miR-499a-5p在骨肉瘤中的表达及其对骨肉瘤发生发展的影响

• 作者: 崔小飞 朱博 李康路 黄汉记 卢德杰 赵劲民
• 来源期刊: 广西医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 骨肉瘤 生物信息学 miR-499a-5p 异质核糖核蛋白C
• 年，卷（期）: 2022,（3）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 375-382
• 页数: 8页
• 分类号: R738.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.16190/j.cnki.45-1211/r.2022.03.006

摘要

目的:探讨miR-499a-5p在骨肉瘤(OS)中的表达及其对OS发生发展的影响.方法:通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)验证miR-499a-5p在OS细胞系(143B、MNNG)及正常成骨细胞(hFOB1.19)中的差异表达,并使用3种在线预测工具对miR-499a-5p的靶基因进行了预测,并取3种数据共同交集得到的靶基因作为候选靶基因.利用靶基因进行基因功能分析(GO)富集分析,并利用京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,然后经过蛋白互作网络(PPI)分析,筛选节点最高的3个关键hub基因,并利用生存分析从这3个关键hub基因中筛选出具有预后意义的关键基因.结果:RT-qPCR结果显示,与正常的成骨细胞比较,OS细胞中miR-499a-5p表达降低(P＜0.05).通过3种在线预测工具预测miR-499a-5p的靶基因并交集获得181个靶基因.GO分析结果表明,生物过程(BP)最显著富集的是RNA聚合酶Ⅱ促子转录的正向调控,细胞组成(CC)最显著富集的是细胞核,分子功能(MF)最显著富集的是蛋白结合.在KEGG的通路富集中,最显著的是人类T细胞白血病病毒1感染信号通路,其次是轴突引导通路、催产素信号通路和T细胞激活信号通路.靶基因的蛋白互作网络分析发现节点最高的3个关键hub基因分别是异质核糖核蛋白C(HNRNPC)、真核翻译起始因子4γ2(EIF4G2)和真核翻译起始因子4A同工型2(EIF4A2).生存分析结果显示,高度表达HNRNPC的OS患者的生存率显著降低(P＜0.05).结论:miR-499a-5p可能通过调控HNRNPC基因对OS发展产生潜在的影响.