利用BSA-Seq方法定位一个水稻早衰相关基因OsBRCA1

• 作者: 蒋家焕 朱永生 陈丽萍 郑燕梅 蔡秋华 谢华安 王爱荣 张建福
• 来源期刊: 福建农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 水稻 突变体 早衰 基因克隆 BSA-seq
• 年，卷（期）: 2022,（2）
• 所属期刊栏目: 作物科学|Crop Science
• 页码范围: 131-137
• 页数: 7页
• 分类号: S511
• 语种: 中文
• DOI: 10.19303/j.issn.1008-0384.2022.002.001

摘要

[目的]水稻早衰突变体是研究水稻衰老机制的良好载体.定位和克隆水稻早衰相关基因,有助于理解水稻早衰的遗传规律和分子机制,为相关基因的作用机制研究奠定基础.[方法]用EMS化学诱变处理粳稻云引,获得一个稳定遗传的早衰突变体w14,与日本晴杂交构建F2分离群体,并在群体中各选择100个隐性单株和显性单株的DNA等量混合,利用BSA-seq分析两个DNA池之间的差异位点,定位水稻早衰相关基因.[结果]突变体w14的早衰表型受单隐性基因控制,对两个DNA池测序结果进行单基因定位和突变基因的鉴定,发现单基因主峰位于Chr3,候选区间为Chr3:27.5～29.5 Mb,进一步在目标区域内找到2个符合条件的候选因果变异.[结论]候选基因LOC_Os03g49210突变位点是由野生型的C突变为T,且该突变位于候选基因的第2外显子上,属于错义突变,造成了该基因编码的第20个氨基酸由T(苏氨酸)变成I(异亮氨酸),从而可能导致了基因功能的改变,因此,将该基因定为本研究的候选基因,因与人类BRCA1同源,命名为OsBRCA1.