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香菇菌丝后熟转色的转录组分析
香菇菌丝后熟转色的转录组分析
作者:
储婷
尚俊军
管婉
杨瑞恒
鲍大鹏
唐利华
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
香菇
转色
转录组
基因差异表达
摘要:
香菇是世界第二大栽培食用菌,其菌丝后熟转色是其特有的栽培过程,并对其产量和品质至关重要.为了进一步了解香菇后熟转色形成的机制,本研究利用Illumina二代高通量测序平台,对初始未转色菌丝(LE 118)、光照下转色菌丝(LE313C)、黑暗下未转色菌丝(LE313W)进行转录组测序,以香菇单核体W1-26基因组为参考基因组进行转录组有参分析,共鉴定出2215个差异表达基因,LE313C比LE118、LE313C比LE313W、LE313W比LE118中分别有1216、1507、1054个基因差异表达.GO富集分析表明,差异表达基因显著富集碳水化合物代谢过程、氧化还原酶活性、水解酶活性、过氧化物酶活性等.KEGG分析发现芳香族化合物的降解在LE313C比LE313W中被显著富集.在LE313C比LE118即香菇菌丝后熟转色发育过程中,筛选出关键差异表达基因包括糖苷酶、疏水蛋白、P450、漆酶、谷氨酸脱氢酶等,表明这些差异基因在香菇菌丝的后熟转色中可能行使重要的生物功能.本研究为进一步研究香菇菌丝后熟及转色形成的机理提供了重要依据.
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文献信息
篇名
香菇菌丝后熟转色的转录组分析
来源期刊
菌物学报
学科
关键词
香菇
转色
转录组
基因差异表达
年,卷(期)
2022,(2)
所属期刊栏目
研究论文|Research papers
研究方向
页码范围
260-273
页数
14页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.13346/j.mycosystema.210250
五维指标
传播情况
被引次数趋势
(/次)
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引文网络
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共引文献
(0)
参考文献
(0)
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研究主题发展历程
节点文献
香菇
转色
转录组
基因差异表达
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
菌物学报
主办单位:
中国科学院微生物研究所
中国菌物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1672-6472
CN:
11-5180/Q
开本:
16开
出版地:
北京市朝阳区北辰西路1号院3号中国科学院微生物研究所B401
邮发代号:
2-499
创刊时间:
1982
语种:
chi
出版文献量(篇)
3221
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8
总被引数(次)
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