长链非编码RNA GIHCG在胆管癌组织中表达及其临床意义

• 作者: 付志豪 王亚东 陈家兴 邓东锋 张秀磊 张晓凡 张晓
• 来源期刊: 中华医学杂志
• 关键词: 胆管肿瘤 癌症基因组图谱 长链非编码RNA GIHCG 标志物
• 年，卷（期）: 2022,（8）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 569-575
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.cn112137-20210729-01689

摘要

目的:通过分析癌症基因组图谱（TCGA）数据库，筛选胆管癌预后相关长链非编码RNA（lncRNA）GIHCG，检测其在胆管癌组织中的表达水平，探讨其临床意义。方法:使用R语言的limma包分析TCGA中31例胆管癌组织和9例癌旁组织的数据，后用survival包及survival ROC包筛选与患者生存相关的差异基因表达lncRNA。通过实时荧光定量聚合酶链反应（real-time PCR）和免疫荧光原位杂交技术（FISH）检测lncRNA的表达水平，分析其与患者临床特征的相关性。采用小干扰RNA敲低lncRNA GIHCG表达水平，通过Transwell检测其对胆管癌细胞系迁移能力的影响。结果:共筛选到2 970个差异表达lncRNAs，其中上调1 852个，下调1 118个。生存分析、受试者工作特征（ROC）曲线［显示lncRNA GIHCG、ROC曲线下与坐标轴围成的面积（AUC）值最大，为0.684］及与临床资料的相关性分析结果表明，lncRNA GIHCG表达与胆管癌患者淋巴结转移具有明显相关性， P<0.001。lncRNA GIHCG在胆管癌组织中的表达显著升高，与肿瘤大小和淋巴结转移密切相关。Transwell实验结果表明，lncRNA GIHCG可促进胆管癌细胞的迁移。 结论:lncRNA GIHCG的表达水平在胆管癌组织中显著升高，且与患者生存、淋巴结转移密切相关，有望成为新的胆管癌诊断或治疗分子标志物。