一株脓液分离的海岸嗜半胱氨酸菌的鉴定及毒力基因分析

• 作者: 冯俊慧 钟一梅 赵婵静 李月桂 陈富 陈茶 屈平华
• 来源期刊: 中华微生物学和免疫学杂志
• 关键词: 海岸嗜半胱氨酸菌 分类鉴定 药敏 毒力基因
• 年，卷（期）: 2022,（4）
• 所属期刊栏目: 细菌学
• 页码范围: 258-264
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.cn112309-20220104-00001

摘要

目的:通过对1株从1名被海虾刺伤的患者脓液分离的致病菌株JM-1进行准确鉴定、药敏试验和毒力基因分析，为海岸嗜半胱氨酸菌( Cysteiniphilum litorale)作为罕见病原体引起临床相关感染的筛检及改善预后提供实验依据。 方法:对分离株进行生化表型鉴定、基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)鉴定、16S rRNA基因测序和系统发育分析，以及基于全基因组序列的平均核苷酸一致性(average nucleotide identity，ANI)、平均氨基酸一致性(average amino acid identity，AAI)分析和系统发育分析，以准确确定其分类学地位；以 E-test法进行药敏试验，并依据CLSI M45-A3土拉弗朗西斯菌解释标准进行结果判读；以VFDB毒力因子数据库对全基因组进行毒力基因注释和分析。 结果:分离株JM-1在哥伦比亚血平板上培养3 d可见灰白色、中等大小、光滑、圆形、凸起的溶血菌落。革兰染色为着色较淡的阴性球杆菌。API NH鉴定结果提示为卡他莫拉菌(生化编码：3010)；Vitek2系统NH卡鉴定无鉴定结果(生物编码：0211002121)。EXS3000质谱仪自建库数据库鉴定为海岸嗜半胱氨酸菌。基于16S rRNA基因和全基因组的系统发育分析均表明该菌株与海岸嗜半胱氨酸菌DSM 101832 T聚类为同一个小的分支，且两者之间的全基因组ANI和AAI值分别为95.07%和95.65%。药敏试验显示分离株JM-1产β-内酰胺酶和青霉素酶，对青霉素耐药，对庆大霉素、链霉素、强力霉素、四环素、环丙沙星、左氧氟沙星、氯霉素敏感。从分离株JM-1基因组注释到了与弗朗西斯菌相似的毒力基因：弗朗西斯菌致病岛(FPI)、Ⅳ型菌毛、荚膜和脂多糖等。 结论:海岸嗜半胱氨酸菌是一种具有弗朗西斯菌毒力相关基因罕见病原体，且其药敏特性亦与弗朗西斯菌相类似。本案例确认了一例由海岸嗜半胱氨酸菌引起的临床感染，自建库的MALDI-TOF质谱系统可用于其快速鉴定。