2020—2021年安徽省急性胃肠炎疫情中GI组诺如病毒基因型多样性分析

• 作者: 史永林 傅荔艳 金晶 葛盈露 王鹏 程鹏 张文艳 孙永
• 来源期刊: 国际病毒学杂志
• 关键词: 诺如病毒 急性胃肠炎 基因型 进化特征
• 年，卷（期）: 2022,（2）
• 所属期刊栏目: 病毒性腹泻监测与控制
• 页码范围: 103-108
• 页数: 6页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1673-4092.2022.02.004

摘要

目的:了解安徽省急性胃肠炎疫情中GI组诺如病毒基因型别分布和进化特征。方法:收集2020年5月至2021年4月急性胃肠炎聚集性疫情病例诺如病毒核酸阳性肛拭子标本，荧光定量PCR分型检测诺如病毒GI和GII基因组，采用RT-PCR扩增GI组诺如病毒聚合酶区（RNA-dependent RNA polymerase，RdRp）和VP1区部分基因片段并测序。运用诺如病毒在线分型工具鉴定基因型别，利用MEGA 6.0软件构建RdRp和VP1区基因系统进化树。结果:45起疫情142份诺如病毒核酸阳性标本中检出23份为GI阳性，占19%（23/142）；119份为GII阳性，占81%（119/142）。20份GI阳性标本PCR扩增产物测序成功。获取的20株诺如病毒RdRp-VP1区序列有6种分型，包括2株GI.1[P1]、2株GI.3[P10]、5株GI.3[P13]、2株GI.4[P4]、7株GI.5[P4]、2株GI.6[P11]。系统进化树显示：GI.1[P1]型安徽株与韩国株（MZ021974）、法国株（MK956173）同属一个进化分支；GI.3[P10]和GI.3[P13]型安徽株与中国台湾株（MN922742）、四川株（MW255366）、韩国株（MZ022026）进化距离较近；GI.4[P4]和GI.5[P4]型安徽株与2019年湖南株（MN938461）、2021年广东株（OK562729）处于一个进化分支；GI.6[P11]型安徽株独立为一个进化簇，与陕西株（MW243609）、日本株（LC646339）进化距离较近。结论:安徽省急性胃肠炎GI组诺如病毒基因型分布呈多样性，有必要开展感染性腹泻疫情分子溯源监测。