肝癌与2型糖尿病的共同相关基因研究

• 作者: 张梦娜 王海洲 刘静
• 来源期刊: 武汉大学学报（医学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 肝细胞癌 2型糖尿病 差异表达基因 基因富集分析
• 年，卷（期）: 2022,（1）
• 所属期刊栏目: 肿瘤学研究
• 页码范围: 70-75
• 页数: 6页
• 分类号: R735.7
• 语种: 中文
• DOI: 10.14188/j.1671-8852.2021.0021

摘要

目的:采用生物信息学方法对肝癌和2型糖尿病的共同差异表达基因进行分析,以揭示肝癌与2型糖尿病之间的潜在病理生理联系.方法:从公共数据库(GEO)下载肝癌与2型糖尿病的基因表达阵列数据,通过R软件对数据进行预处理,获得重叠差异表达基因,进一步利用DAVID和STRING数据库对这些差异基因进行基因富集分析并构建蛋白互作网络.使用在线数据库GEPIA进行生存分析.结果:通过差异基因筛选,我们获得328个重叠差异基因,包括176个共同差异基因以及152个独立差异基因.共同差异基因包括78个上调基因,98个下调基因,独立差异基因包含在糖尿病中下调的82个基因以及在肝癌中下调的70个基因.通过基因富集分析发现,共同差异基因主要富集在DNA损伤以及免疫调控、细胞凋亡等功能,独立差异基因的功能主要富集在有机氮化合物代谢,最后通过以共同差异基因为目标构建蛋白互作网络,获得核心节点蛋白.对核心节点蛋白进行生存分析,得到6个生存相关核心基因.结论:本研究通过生物信息学方法筛选同时与肝癌和2型糖尿病相关的8个核心基因,为研究糖尿病相关肝癌提供靶点参考.