基于高通量分子对接技术筛选干预COVID-19的潜在活性分子及中药

• 作者: 祁建宏 董芳旭 王轲 刘子铭 朱锦璐
• 来源期刊: 北京联合大学学报（自然科学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 受体酪氨酸激酶(AXL) 血管紧张素转换酶2(ACE2) 3C样蛋白酶(3CL pro) COVID-19 潜在活性分子 中药
• 年，卷（期）: 2022,（1）
• 所属期刊栏目: 生命科学与生物技术
• 页码范围: 44-53,71
• 页数: 11页
• 分类号: R965.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.16255/j.cnki.ldxbz.2022.01.007

摘要

2019年12月以来,由严重急性呼吸综合征冠状病毒2型(severe acute respiratory syndrome coronavirus-2,SARS-CoV-2)感染引起的新型冠状病毒肺炎(novel coronavirus disease 2019,COVID-19)在全球范围内流行和传播,具有较高的传染性、发病率和死亡率.目前,国内外仍缺乏特效且无明显副作用的治疗药物.基于COVID-19的特异性靶点(AXL、3CL pro、ACE2),利用高通量分子对接技术在TCMSP数据库中虚拟筛选潜在活性小分子,并从TCMSP、TCMIP和TCMID数据库中预测相应的潜在中药.结果显示,作用于AXL、3CL pro和ACE2的共靶点小分子有47个,包括萜类、生物碱类、黄酮类、醌类和苷类等,其中萜类所占比例最高.其中Chelidimerine与AXL和3CL pro的结合能力最强,可能是一种治疗COVID-19的潜在化合物.基于ADME和Lipinski规则,得到10个具有良好药代动力学特征的化合物.此外,预测获得了13味治疗COVID-19的高频中药.本实验获得的针对COVID-19的潜在活性分子(PAM)和潜在中药,可为后续的抗病毒活性研究、新药开发和临床应用提供有意义的参考.