'芙蓉李'糖转运蛋白家族基因鉴定及表达分析

• 作者: 姜翠翠 方智振 周丹蓉 林炎娟 叶新福
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 李 基因组 糖转运 基因家族 鉴定 生物信息学 表达分析
• 年，卷（期）: 2022,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文|Research Papers
• 页码范围: 252-264
• 页数: 13页
• 分类号: S662.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2020-0724

摘要

基于'芙蓉李'(Prunus salicina)基因组数据,采用生物信息学分析方法鉴定糖转运蛋白家族基因,并对其蛋白质理化特性、亚细胞定位、系统进化树、蛋白质保守结构域以及表达模式进行分析.共鉴定出49个该家族基因,根据保守结构域和系统发育分析将其分为7个亚家族.蛋白质介于313～948个氨基酸之间,预测定位于质膜或液泡膜;所有的蛋白都含有保守的糖转运体结构域(PF00083),其中大多数含有12个跨膜螺旋.通过比对'芙蓉李'果实发育过程的RNA-seq数据,对49个基因进行表达谱分析,其中15个在果实不同发育阶段差异表达;qRT-PCR分析表明,15个差异表达基因中有9个基因与果实葡萄糖和蔗糖含量显著正/负相关,其中1个肌醇转运蛋白亚家族基因(PsINT4)、1个糖转运蛋白亚家族基因(PsSTP11)、1个糖促进蛋白亚家族基因(PsSFP5)和1个液泡单糖转运蛋白亚家族基因(PsTMT1)在'芙蓉李'果实发育过程中具有较高的表达量,可能在'芙蓉李'果实发育和成熟过程中对糖分积累起重要作用.