两种诱变处理下紫花苜蓿全基因组DNA甲基化图谱分析

• 作者: 申晓慧
• 来源期刊: 草地学报
• 学科: 农学
• 关键词: 紫花苜蓿 DNA甲基化 重亚硫酸盐测序 表观遗传
• 年，卷（期）: 2022,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 46-54
• 页数: 9页
• 分类号: S816.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.11733/j.issn.1007-0435.2022.01.006

摘要

为了探究不同诱变处理对紫花苜蓿表观遗传学效应的影响,试验采用甲基磺酸乙酯(EM S)和60 CO-γ两种诱变方法对紫花苜蓿种子进行处理,采用重亚硫酸盐测序(BS-seq)技术,对紫花苜蓿诱变前后全基因组DNA甲基化图谱进行分析.结果表明,紫花苜蓿体内的DNA甲基化主要有mCG,mCHH和mCHG 3种类型;C位点发生甲基化的比率在EMS诱变处理下表现为上升,在60 CO-γ诱变处理下表现为下降.此外,DNA甲基化主要发生在CG序列;对不同诱变处理组的差异甲基化区域(DMR)鉴定发现有105个基因在两组比较中均存在DMR,KEGG通路富集分析表明,在DM R相关基因中显著富集的通路主要包括氮代谢通路(Nitrogen metabolism)、淀粉和蔗糖代谢途径(Starch and sucrose metabolism)、脯氨酸代谢(Proline metabolism)等生物学过程.因此,诱变改变了苜蓿DNA甲基化水平,为诱变突变体的筛选提供了丰富材料.