基于数据库分析MECOM在卵巢癌中的表达和临床意义

• 作者: 李荣 柳宇 徐淦伟
• 来源期刊: 国际妇产科学杂志
• 关键词: 卵巢肿瘤 MECOM 数据库 基因组学 计算生物学
• 年，卷（期）: 2022,（1）
• 所属期刊栏目: 妇科肿瘤研究|Research on Gynecological Malignancies
• 页码范围: 43-48
• 页数: 6页
• 语种: 中文
• DOI: 10.12280/gjfckx.20210375

摘要

目的:探究MECOM在卵巢癌中的表达情况及临床意义.方法:收集Oncomine、GEPIA数据库中关于MECOM的数据信息,并对数据库中的资料进行二次分析;运用cBioportal、Coexpedia、STRING数据库分析MECOM在卵巢癌中的突变、共表达及互作蛋白情况;利用Kaplan-Meier Plotter分析卵巢癌患者MECOM mRNA的表达水平与患者预后的关系.结果:Oncomine数据库中对不同类型肿瘤有关MECOM基因的研究共353项,差异有统计学意义的有99项(高表达33项,低表达66项),其中对卵巢癌研究有10项,均显示MECOM高表达;这一结果在GEPIA数据库中也得到证实.突变分析结果显示卵巢癌患者中有30％的患者MECOM基因发生突变,突变类型包括错义突变、融合突变和截断突变.共表达分析发现了275个与其共表达的基因;蛋白互作分析发现MECOM蛋白可能与NR2E1、MTA1、HDAC1、TP53、PPARG、EZH2、JUN、MBD3、HDAC2和CTBP1蛋白有相互作用.MECOM mRNA高表达组卵巢癌患者总生存期低于低表达组(P=0.013).结论:MECOM基因在卵巢癌中高表达,且其翻译的蛋白通过和多种蛋白相互作用发挥生物学效应,其mRNA表达水平与卵巢癌患者生存预后相关,有望为卵巢癌分子靶向治疗提供新思路.