基于单细胞测序数据系统分析SARS-CoV-2受体ACE2在胰腺中的表达

• 作者: 张立俊 于帆 陈科谚 汤希 国世星 袁新华 何海洪
• 来源期刊: 海南医学
• 学科: 医学
• 关键词: 血管紧张素转化酶2 新型冠状病毒肺炎 严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2 胰腺 腺泡细胞 基因-概念网络
• 年，卷（期）: 2022,（8）
• 所属期刊栏目: 临床研究|Clinical Research
• 页码范围: 959-964
• 页数: 6页
• 分类号: R511
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1003-6350.2022.08.002

摘要

目的 通过单细胞测序数据系统分析严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)受体ACE2在胰腺中的表达,为新型冠状病毒感染性疾病(COVID-19)患者提供了生物信息学证据.方法 利用单细胞表达谱数据库中的人类胰腺组织单细胞测序数据用于ACE2表达阳性细胞的聚类分析.Scanpy软件用于分析scRNA序列的下游数据.Seurat R软件包用于原始基因表达矩阵的进一步数据分析.然后进行功能富集分析,并使用可视化的R软件对ACE2阳性标记基因进行了基因概念网络分析.结果 ACE2主要分布于胰腺腺泡细胞和导管内皮细胞,ACE2阳性细胞在与膜靶向蛋白、胞浆核糖体和内质网蛋白定位建立相关的病毒翻译相关基因集中高度富集.ACE2阳性腺泡细胞中的标记基因与各种类型胰腺炎的发生最为相关,而ACE2阳性胰腺导管内皮细胞中的标记基因与癌前病变密切相关.结论 研究结果表明,人胰腺外分泌腺是SARS-CoV-2感染的潜在靶器官,可能对这种快速且高度传播的疾病的病理生理学理解产生重大影响.