弓形虫穿孔素样蛋白2生物信息学分析

• 作者: 田晓薇 张晶 张子航 梅雪芳 张振超 李祥瑞 王帅
• 来源期刊: 热带医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 刚地弓形虫 穿孔素样蛋白2 生物信息学分析 疫苗
• 年，卷（期）: 2022,（1）
• 所属期刊栏目: 实验研究论著|Experiment Research
• 页码范围: 12-17
• 页数: 6页
• 分类号: R382.5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-3619.2022.01.003

摘要

目的 基于生物信息学分析弓形虫穿孔素样蛋白2(TgPLP2)的结构及性质、翻译后的修饰以及抗原指数.方法 利用 ProtParam、SignalP5.0、TMHMM、MegAlign、MAFFT、SMART、SOPMA、Swiss model、NetPhos、SYFPEITHI 及IEDB等软件分别预测TgPLP2的理化性质、信号肽、跨膜区、蛋白质的结构、翻译后修饰情况、B细胞和T细胞抗原表位.结果 TgPLP2是一种亲水性蛋白,相对分子质量为92 185.19,含有79个潜在的翻译后修饰位点,无任何跨膜结构域.二级结构以无规卷曲和α螺旋为主.此外,还检测到了几种可能的B细胞和T细胞表位.蛋白的抗原性分析表明其具有抗原性.结论 TgPLP2可能是一种具有良好免疫原性的蛋白,理论上可诱导强大的免疫反应,且具有多个潜在的B细胞和T细胞表位,综合分析提示TgPLP2是一种合适的弓形虫疫苗候选分子.