云南省番茄莴苣褪绿病毒分子检测及遗传进化分析

• 作者: 冯丽肖 胡荣 卜姗 张德咏 罗香文 李凡 丁铭 张卓 张松柏 刘勇
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 番茄 莴苣褪绿病毒 分子检测 系统发育分析 进化
• 年，卷（期）: 2022,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告|Research Notes
• 页码范围: 141-147
• 页数: 7页
• 分类号: S641.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2020-1087

摘要

采集了77份云南省疑似感染莴苣褪绿病毒(lettuce chlorosis virus,LCV)的番茄样本,采用特异性反转录PCR扩增LCV次要外壳蛋白基因(minor coat protein,CPm)近全长序列,常规Sanger测序法测定相应片段序列,并对其进行遗传进化分析.结果 表明,LCV特异性反转录PCR扩增得到与预期大小(1.38 kb)一致的特异性条带;采集的77份番茄样本中LCV检出率为12.99％.测定的LCV CPm;发育分析表明,所有LCV分离物可分为3个亚簇,具有明显的地域特性,其中LCV云南分离物与中国其他地区LCV分离物聚为一亚簇,来自美洲和欧洲分离物分别聚为一个簇.遗传进化分析表明,LCV云南分离物YN58有1个重组事件,序列中嘧啶(C/T)替换率最高(25.25),呈现独立进化、加速扩展趋势.这是在云南省首次报道发现LCV.