DNA微阵列芯片与质谱技术快速鉴定非结核分枝杆菌的差异性分析

• 作者: 吴祥兵 吴联朋 项领 陈秀平 唐少华
• 来源期刊: 中华医院感染学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 非结核分枝杆菌 DNA微阵列芯片 基质辅助激光解析电离飞行时间质谱 16s rRNA 菌种鉴定
• 年，卷（期）: 2022,（1）
• 所属期刊栏目: 基础研究|Basic Research
• 页码范围: 16-20
• 页数: 5页
• 分类号: R378.91
• 语种: 中文
• DOI: 10.11816/cn.ni.2022-216035

摘要

目的 比较基因芯片技术与基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)在非结核分枝杆菌(NTM)菌种鉴定上的差异,为临床快速诊断NTM病提供帮助.方法 应用BACTECTM MGIT 960仪器对保存的NTM菌株进行液体培养法复苏;分别使用基因芯片法、质谱法与16 s rRNA测序对74株NTM进行菌种鉴定;以16 s rRNA测序作为参考方法分析比较基因芯片法与质谱法两种方法鉴定结果的差异与优劣势.结果 通过测序,74株NTM鉴定结果为胞内分枝杆菌37株,脓肿分枝杆菌19株,M.marseillense/M.yongonense 7株,鸟分枝杆菌5株,堪萨斯/胃分枝杆菌2株,M.chimaera、哥伦比亚分枝杆菌、海分枝杆菌、猪分枝杆菌均1株.基因芯片法与测序法相比有12株结果不同,准确率为83.8％,鉴定到复合群准确率为95.9％;MALDI-TOF MS有2株无结果,与测序相比有7株结果不同,准确率为87.8％,鉴定到复合群准确率为97.3％.检测时间上,基因芯片法鉴定1个样本需要6 h,质谱法则仅需1 h.结论 与16 s rRNA测序金标准相比,两种鉴定方法鉴定到菌种复合群的准确率均在95％以上,展现两种方法在NTM菌种鉴定上优异的性能,两种方法均能为临床更快速准确鉴定NTM提供支持.质谱法在NTM鉴定的菌种谱、菌种分辨能力、时间和经济成本上均要优于基因芯片法,更适合实验室常规开展.