应用生物信息学方法对着丝粒蛋白L进行泛癌中的免疫分析

• 作者: 王芬 康金麟 李炫飞 冯茂辉 周福祥
• 来源期刊: 中华实验外科杂志
• 关键词: 着丝粒蛋白L 泛癌 免疫浸润
• 年，卷（期）: 2022,（4）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 707-709
• 页数: 3页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.cn421213-20210907-01261

摘要

目的:探究着丝粒蛋白L(CENPL)在泛癌中的表达，并研究CENPL表达与免疫浸润之间的关系。方法:通过人类蛋白质图谱(HPA)和TIMER数据库探讨CENPL在人体正常组织及33种癌症类型中的基因表达情况。应用R语言计算了33种癌症的免疫细胞浸润、ESTIMATE评分、肿瘤突变负荷(TMB)、微卫星不稳定性(MSI)及免疫检查点基因相关性。结果:CENPL的mRNA表达水平在16种肿瘤中高于相对应的癌旁组织( P<0.01)。CENPL表达与31种肿瘤中的免疫细胞浸润相关( P<0.05)。此外，CENPL的表达水平与免疫评分相关性最高的肿瘤是肾上腺皮质癌( R＝-0.43， P<0.01)；基质评分相关性最高的肿瘤是睾丸癌( R＝-0.43， P<0.01)；免疫综合评分相关性最高的肿瘤是肾上腺皮质癌( R＝-0.39， P<0.01)。CENPL表达与18种肿瘤的TMB呈正相关，与2种癌症的TMB呈负相关。CENPL表达与5种癌症的MSI呈正相关，与3种癌症的MSI呈负相关( P<0.05)。在肾透明细胞癌中，CENPL的表达与40个免疫检查点的表达具有显著相关性( P<0.05)，差异有统计学意义。 结论:CENPL在泛癌中表达升高，与多种癌症的免疫浸润相关。