棉铃虫CCE001a蛋白结构与功能的生物信息学分析

• 作者: 张莉 王海亮 马雪儿 牛俊丽 陈程 张文举
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: CCE001a 羧酸酯酶 解毒 蛋白质修饰位点 生物信息
• 年，卷（期）: 2022,（1）
• 所属期刊栏目: 动物科学·生物技术|Animal Science and Biotechnology
• 页码范围: 102-105
• 页数: 4页
• 分类号: S435.622+.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0517-6611.2022.01.026

摘要

[目的]深入预测CCE001a蛋白结构与生物学功能.[方法]使用生物信息学方法预测CCE001a基因所编码的蛋白质,预测其功能与结构.[结果]该蛋白的总氨基酸残基数为556个,分子式为C2865 H4321 N7370811 S23,蛋白的等电点pI为5.32,带正电的氨基酸残基(Arg+Lys)为58个,带负电的氨基酸残基(Asp+Glu)为75个,蛋白不稳定系数为35.22,脂肪系数为75.91,总平均亲水性系数为-0.262;CCE001a蛋白有一个脱氢酶超家族(cl21494)结构域;经分析显示,α-螺旋、无规律的卷曲是这种蛋白质的主要二次结构,分别占31.35％和46.49％,还包括3.96％的β-转角和18.20％的扩展延伸链.经过三级结构学预测表明,该蛋白包括α-螺旋、β-转角;该蛋白亚细胞被确认为定位在内质网内,存在着信号肽的序列,初步可以认为是具有分泌力的亲水蛋白,且没有出现跨膜蛋白,共有37个磷酸化位点,1个N-糖基化位点.[结论]该研究可为研究CCE001a的解毒机制提供理论基础.