计算机辅助模拟技术在脲酶抑制剂筛选中的应用

• 作者: 谢勇飞 束维正 李慧敏 胡婷婷 陈骏 中盐安徽红四方肥业股份有限公司
• 来源期刊: 肥料与健康
• 学科: 农学
• 关键词: 脲酶抑制剂 计算机辅助模拟 分子对接 应用
• 年，卷（期）: 2023,（2）
• 页码范围: 24-28,39
• 页数: 6页
• 语种: 中文

摘要

尿素施入土壤后发生快速水解，植物无法有效吸收施入土壤中的养分，造成氮素利用率较低。通过分子对接模拟软件，对脲酶4gy7晶体结构进行处理，经分子动力学优化，分别与尿素、正丁基硫代磷酰三胺(NBPT)、对苯二酚(HQ)、(2-硝基苯基)磷酸三酰胺(2-NPT)、ZINC数据库中的9 617个小分子进行分子对接，评价其相互作用关系，筛选潜在的脲酶抑制剂小分子。结果表明：尿素、NBPT、HQ、2-NPT与脲酶的平均结合能依次为30.91、32.92、28.36、18.63 kJ/mol, NBPT的效果较理想；9 617个小分子的相互作用分析显示，其中5 883个小分子可能与脲酶存在相互作用关系，筛选到35个平均结合能大于55 kJ/mol的潜在脲酶抑制剂。计算机辅助模拟技术为新型脲酶抑制剂的开发提供了新的思路。