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南方农业学报期刊
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番木瓜抗倒伏优势微生物及候选基因筛选
番木瓜抗倒伏优势微生物及候选基因筛选
作者:
陈仕淼
郑剑
陆覃昱
张继
石兰蓉
马松琼
范兢升
甘卫堂
广西亚热带作物研究所
原文服务方:
南方农业学报
番木瓜
加权基因共表达网络(WGCNA)
优势微生物
抗倒伏
基因挖掘
摘要:
【目的】筛选抗倒伏性强的番木瓜根际优势微生物,挖掘番木瓜抗倒伏差异表达的关键基因,为揭示番木瓜抗倒伏机制及相关品种选育提供参考。【方法】试验设常规施肥量处理(每株施用2.5 kg有机肥,CK)、缺肥处理(不施有机肥,WLR)和高有机肥处理(每株施用10 kg有机肥,SLR)3个处理,根据其转录组数据和根际微生物数据,利用加权基因共表达网络(WGCNA)关联分析番木瓜抗倒伏相关的关键基因,并分析根际微生物变化情况。【结果】SLR处理的植株抗倒伏性最强,其次是CK,WLR处理植株的抗倒伏性最差。WLR处理植株的株高、节间长度和茎粗均显著低于CK和SLR处理的植株(P<0.05)。通过微生物组数据分析得到影响抗倒伏性状优势微生物为链丝菌属(Streptomyces)、慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)、RB41菌属及噬几丁质菌属(Chitinophaga)。通过WGCNA分析得到2个与番木瓜抗倒伏性能相关的品蓝模块和淡黄模块,进而对这2个模块构建基因共表达网络,筛选出可能与番木瓜抗倒伏性能密切相关的乙酰辅酶A乙酰转移酶基因(AACT)、聚腺苷酸结合蛋白基因(RBP47)、线粒体输入内膜转位酶亚基基因(TIM9)、钙依赖通道7TM区域基因(HYP1)、韧皮部蛋白质丝网络蛋白基因(SEO)和半胱氨酸蛋白酶抑制剂a基因(CPI)等6个核心基因。核心基因功能分析结果显示,品蓝模块涉及番木瓜萜类代谢调控,而淡黄色模块涉及番木瓜韧皮部生长代谢调控。【结论】根际优势微生物与番木瓜抗倒伏性密切相关,其可通过调控番木瓜茎的生长从而提高抗倒伏性,可作为抗倒伏性强番木瓜品种选育的微生物筛选标记之一。
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文献信息
篇名
番木瓜抗倒伏优势微生物及候选基因筛选
来源期刊
南方农业学报
学科
农学
关键词
番木瓜
加权基因共表达网络(WGCNA)
优势微生物
抗倒伏
基因挖掘
年,卷(期)
2023,(02)
所属期刊栏目
热带水果专栏
研究方向
页码范围
18-28
页数
11页
分类号
字数
语种
中文
DOI
五维指标
传播情况
被引次数趋势
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版权信息
全文
全文.pdf
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2023(0)
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研究主题发展历程
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番木瓜
加权基因共表达网络(WGCNA)
优势微生物
抗倒伏
基因挖掘
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
南方农业学报
主办单位:
广西壮族自治区农业科学院
出版周期:
月刊
ISSN:
2095-1191
CN:
45-1381/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1964-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
7029
总下载数(次)
0
总被引数(次)
43586
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