2022—2023年我国部分地区猪A群轮状病毒分子流行病学调查分析

• 作者: 谷拉强 陶然 程曦 张雪寒 周金柱 王丹丹 王建新 李彬
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 猪A群轮状病毒 VP4基因 VP7基因 分子流行病学
• 年，卷（期）: 2024,（10）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医·水产·蚕桑
• 页码范围: 268-276
• 页数: 9页
• 语种: 中文

摘要

【目的】探究我国部分地区猪A群轮状病毒（RVA）的分子流行病学特征，明确当前的优势基因型，为RVA科学防控与疫苗研发提供理论依据。【方法】2022年1月—2023年3月收集江苏、江西、福建、山西和贵州5省36个规模化猪场送检的434份腹泻仔猪粪便样品，采用RT-PCR检测样品RVA阳性情况，对部分RVA阳性样品的VP7和VP4基因进行扩增及测序，与各型参考序列进行多序列比对，使用MegAlign进行核苷酸序列同源比对分析，并采用MEGA 7.0的邻接法构建系统发育进化树。【结果】RT-PCR检测结果显示，434份腹泻仔猪粪便样品中RVA阳性样品为196份，阳性检出率为45.16%。2022年与2023年初的阳性检出率分别为40.37%(132/327)和59.81%(64/107)。根据样品来源地区，RVA阳性检出率最高的是江苏（57.70%），其次是江西（55.71%），福建、贵州和山西的RVA阳性检出率分别是35.66%、30.00%和22.23%。共获得各地区12株RVA的VP4和VP7基因序列信息，遗传进化分析结果表明，G型中G9为优势基因型（占83.4%）,G4和G5分别占8.3%；而P型中P7为优势基因型（占75.0%），其次为P13和P23，分别占16.7%和8.3%;12株RVA分属4种基因型组合，分别为G9P[7]（占75.0%）、G5P[13]（占8.3%）、G9P[13]（占8.3%）和G4P[23]（占8.3%）。【结论】我国部分省份猪场RVA阳性检出率持续升高，猪群中RVA基因型复杂多样，优势基因型组合为G9P[7]。因此，今后有必要对猪群中RVA的流行情况进行持续监测，结合基因型致病性制定预防措施并开发针对性疫苗。