冠心病进展相关基因筛选及冠心Ⅱ号方干预靶点的预测

• 作者: 骆金文 刘敏 于燕乔 谭宇 史大卓 马晓娟
• 来源期刊: 中西医结合心脑血管病杂志
• 关键词: 急性心肌梗死 稳定型冠心病 冠心Ⅱ号方 转录组 干预靶点 基因筛选
• 年，卷（期）: 2024,（3）
• 所属期刊栏目: 临床医学论著
• 页码范围: 9-17
• 页数: 9页
• 语种: 中文

摘要

目的:探索冠心病疾病进展相关基因，并预测冠心Ⅱ号方防治冠心病的作用靶点。方法:从基因表达综合数据库(GEO)下载急性心肌梗死(AMI)与稳定型冠心病(SCAD)病人转录组表达谱，通过差异表达分析和加权基因共表达网络分析(WGCNA),筛选冠心病疾病进展相关基因，并针对冠心病进展相关基因进行基因本体(GO)功能分析与京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。从中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库下载冠心Ⅱ号方的有效成分及药效靶点，与冠心病疾病进展相关基因进行交集分析，获得冠心Ⅱ号方防治冠心病的潜在靶点。结果:通过差异表达分析比较AMI和SCAD转录组表达谱，共获得166个差异表达基因(DEGs)。通过WGCNA获得与AMI相关的基因模块Black。取DEGs与Black模块的交集，获得64个冠心病疾病进展相关基因。从TCMSP数据库共获得224个冠心Ⅱ号方的药效靶点，将药效靶点与冠心病疾病进展相关基因取交集，得到冠心Ⅱ号方防治冠心病的潜在作用靶点，即过氧化物酶体增殖物激活受体(PPARG)、单核细胞分化抗原CD14(CD14)和细胞色素P4501b1(CYP1B1)。结论:细胞因子信号转导抑制因子3(SOCS3)、嗜酸性粒细胞阳离子相关蛋白(ECRP)、肿瘤坏死因子受体超家族成员10D(TNFRSF10D)、S100钙结蛋白A9(S100A9)等64个基因可能与冠心病疾病进展相关，其中，PPARG、CD14、CYP1B1是冠心Ⅱ号方防治冠心病的潜在作用靶点。