基于网络药理学与分子对接技术探究炙甘草汤抗心肌缺血再灌注损伤的作用机制

• 作者: 任海云 蔚蓁 山西中医药大学中药与食品工程学院
• 来源期刊: 中西医结合心脑血管病杂志
• 关键词: 心肌缺血再灌注损伤 炙甘草汤 网络药理学 分子对接 作用机制
• 年，卷（期）: 2024,（3）
• 所属期刊栏目: 临床医学论著
• 页码范围: 18-25
• 页数: 8页
• 语种: 中文

摘要

目的:运用网络药理学方法和分子对接技术探讨炙甘草汤减轻心肌缺血再灌注损伤(MIRI)的作用机制。方法:利用中医药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)与中药分子机制生物信息学分析工具(BATMAN-TCM)获取炙甘草汤有效成分并预测其作用靶点，然后应用人类基因综合(GeneCards)与人类疾病相关基因和突变信息的综合平台(DisGeNET)数据库预测MIRI靶点，通过Venny在线绘图软件获取炙甘草汤抗MIRI潜在作用靶点。利用蛋白质相互作用分析数据库(STRING数据库)平台构建蛋白互作(PPI)网络，并通过Cytoscope 3.9.1软件可视化、筛选出核心靶点，利用Metascape基因功能分析平台对筛选出的核心靶点进行基因本体(GO)富集分析与京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析，探究炙甘草汤抗MIRI机制，再次利用Cytoscape 3.9.1软件构建活性成分-疾病-核心靶点-通路网络。最后利用分子对接程序AutoDock vina对炙甘草汤主要活性成分与其核心靶点结合活性进行验证。结果:经筛选获得炙甘草汤147个活性成分、865个基因靶点，MIRI 144个靶标，通过Venny数据库获取炙甘草汤抗MIRI潜在作用靶点79个；经PPI网络分析并筛选出40个关键靶点，其中肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-6(IL-6)、蛋白激酶B(AKT1)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、一氧化氮合酶3(NOS3)、过氧化氢酶(CAT)、CC趋化因子配体2(CCL2)、髓过氧化物酶(MPO)均与炎症反应或氧化应激有关。经GO富集分析发现氧化应激、炎症反应与此生物学过程密切相关；经KEGG分析探究炙甘草汤抗MIRI的通路，共映射出178条信号通路。将炙甘草汤活性成分-疾病-核心靶点-通路网络中排名居前3位的成分及其关键靶点进行验证，结果显示炙甘草汤主要活性成分与关键作用靶点结合活性很强，能形成稳定的化合物。结论:甘草查尔酮A、人参皂苷Rh2、6-醛基异麦冬黄酮B、山柰酚、芒柄花黄素、麦冬皂苷C等为炙甘草汤抗MIRI的主要成分，通过TNF、IL-6、AKT1、VEGFA、NOS3、CAT、CCL2、MPO等核心靶点调控丝裂原活化蛋白激酶(MAPKs)、TNF、Toll样受体-4(TLR4)、缺氧诱导因子-1(HIF-1)、磷脂酰肌醇-3激酶/蛋白激酶B(PI3K/AKT)、雷帕霉素靶蛋白(mTOR)、转化生长因子-β(TGF-β)、核转录因子-κB(NF-κB)等信号通路，减轻改善MIRI,体现出炙甘草汤多成分-多靶点-多途径的作用优势，为进一步深入动物学实验与临床试验提供了数据与理论支持。