晒田环境胁迫下克氏原螯虾卵巢的转录组学分析

• 作者: 袁畅 李蔚 何苹萍 陆专灵 黄彬胜 王大鹏 李文红
• 来源期刊: 南方农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 克氏原螯虾 卵巢 发育调控 晒田环境胁迫 转录组
• 年，卷（期）: 2024,（3）
• 所属期刊栏目: 专题：转录组测序
• 页码范围: 51-63
• 页数: 13页
• 语种: 中文

摘要

【目的】运用转录组测序技术探究不同晒田环境胁迫下克氏原螯虾卵巢的基因表达变化，筛选出与其卵巢发育相关的候选基因及信号通路，为研究晒田胁迫方式促进克氏原螯虾卵巢发育的作用机制提供理论依据。【方法】以雌性克氏原螯虾为研究对象，分别在晒田环境胁迫0 d(CK)、3 d(T1)、7 d(T2)和10 d(T3)时采样，构建卵巢c DNA文库进行转录组测序，对差异表达基因（DEGs）进行GO功能注释及KEGG信号通路富集分析。【结果】共获得86377个Unigenes，在Nr、KOG/COG、Swiss-Prot和KEGG库中成功注释到22712个Unigenes；获得1115个胁迫组（T1、T2和T3）与CK的DEGs。KEGG信号通路富集分析结果表明，DEGs富集的PI3K-Akt信号通路、GnRH信号通路和雌激素信号通路与卵巢发育相关。实时荧光定量PCR验证结果表明，3个DEGs的表达模式与转录组分析结果基本一致，证明转录组数据准确可靠。筛选得到B2M、TUBA1B、MT-CYB、MT-ND1、MT-ND2、MT-ND4、DSX、Pck2、PIM3和serine protease nudel-like等10个与卵巢发育相关的DEGs，并对其表达量进行分析，结果表明各基因在晒田胁迫期间均可调控卵巢发育。【结论】B2M、TUBA1B、MT-CYB、MT-ND1、MT-ND2、MT-ND4、DSX、Pck2、PIM3和serine protease nudel-like等10个DEGs及PI3K-Akt信号通路、GnRH信号通路、雌激素信号通路等3个富集通路在晒田胁迫期间参与卵巢发育调控。