水稻长护颖基因Oslsl的遗传分析和序列鉴定

• 作者: 程玲 黄福钢 王雅宣 李定国 邱永福
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 水稻 长护颖 等位基因 遗传分析 基因定位
• 年，卷（期）: 2024,（3）
• 所属期刊栏目: 植物保护 农业气象
• 页码范围: 262-269
• 页数: 8页
• 语种: 中文

摘要

【目的】对水稻花器官突变材料进行基因定位和克隆，为深入研究水稻颖花发育的分子机理提供新材料。【方法】分别于孕穗期和成熟期观察具有长护颖表型的籼稻品种沙优选2号(lsl098)和正常表型品系9311的花器官和籽粒形态特征。将lsl098与9311杂交构建F2群体，对长护颖基因Oslsl(Long sterile lemma)进行遗传分析、基因定位和测序分析。【结果】形态观察发现，lsl098的长护颖表型在幼穗分化第5期起可明显观察到，成熟期的长护颖形态近似外稃，呈“V”形开口，不影响结实率和发芽率。遗传分析结果显示，正、反交分别获得的155和208个F2单株中长护颖与正常表型植株数目符合1∶3分离比(x21∶3<x20.05,1=3.84)，表明该表型受1对隐性基因控制。通过构建长护颖表型池和正常表型池，采用集团分离分析法确定与护颖表型共分离的分子标记，进一步筛选重组单株，并结合重组单株表型，将Oslsl定位在7号染色体短臂分子标记7M063和G01031之间，2个标记对应日本晴参考基因组物理距离为838.8 kb，定位区段包含已克隆的长护颖基因G1(LOC＿Os07g04670)。测序分析发现，与日本晴和9311的基因组序列相比，Oslsl序列包含了3个SNP突变，2 bp插入和145 bp缺失。【结论】lsl098携带的长护颖基因Oslsl是已克隆G1基因的新等位基因。