昆明裂腹鱼FGF基因的测序验证与进化分析

• 作者: 王小会 苗贵东 彭紫威 龙晓武 王封瑞 刘显威
• 来源期刊: 科技创新与生产力
• 关键词: 昆明裂腹鱼 FGF基因 测序 进化分析
• 年，卷（期）: 2024,（11）
• 所属期刊栏目: 技术创新
• 页码范围: 112-114,118
• 页数: 4页
• 语种: 中文

摘要

利用第三代测序得到全长转录组文库的FGF基因序列进行引物设计，PCR产物直接测序验证基因序列，获得FGF基因全长为787 bp。FGF基因的ORF长度为699 bp，共编码232个氨基酸。核苷酸序列同源性比对结果发现与鲤鱼FGF13基因同源性为99.50%，与金线鲃、鲤鱼、鲫鱼、斑马鱼对应的FGF基因的同源性较高、亲缘关系较近；进一步与FGF基因各亚型氨基酸序列比对发现，与FGF13a-2基因的氨基酸序列的同源性为99.01%，判断该基因为昆明裂腹鱼FGF13a-2基因。结构域预测发现有受体结合位点和肝素结合位点，FGF基因编码蛋白的二级结构中α-螺旋占比为22.41%、β-转角占比为8.19%、延伸链占比为21.55%、无规卷曲占比为47.84%，具备FGF蛋白转录因子超家族特征。