生物信息学期刊
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生物信息学

China Journal of Bioinformatics

CSTPCD

影响因子 0.3945
本刊是由哈尔滨工业大学主办的生物信息及相关领域的国内外公开发行的学术刊物,报道我国生物信息技术研究开发的重要成果和国内外生物信息技术及其产业化最新进展。
主办单位:
哈尔滨工业大学
ISSN:
1672-5565
CN:
23-1513/Q
出版周期:
季刊
邮编:
150001
地址:
黑龙江省哈尔滨市西大直街92号哈尔滨工业大学邵逸夫科学馆一楼
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  • 作者: 易图永 池田逹哉
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2007年1期
    页码:  1-4
    摘要: 根据http://www.tigr.org中与小麦几丁质酶基因相关的序列TC187877,设计引物,分别从小麦品种Gamenya和苏麦3号中扩增到大小约为1 000bp的片段.经序列测定和软...
  • 作者: 林英武 黄仲贤
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2007年1期
    页码:  5-7
    摘要: 以牛肝微粒体细胞色素b5(CYB5_BOVIN)为切入点,利用生物学信息学方法获得一系列细胞色素b5家族的成员蛋白,同时对蛋白序列进行多重对齐分析及进化分析,借此为细胞色素b5蛋白的分子设计...
  • 作者: 于寒颖 杨谦
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2007年1期
    页码:  8-11
    摘要: 核盘菌编码AROM蛋白的arom基因已经被克隆测序,本文根据该基因翻译的氨基酸序列用同源模建方法和从头模建方法分析了AROM蛋白各结构域的三级结构和功能位点,以及该蛋白二聚体可能的组装方式....
  • 作者: 李前忠 林昊
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2007年1期
    页码:  12-14
    摘要: 统计了大肠杆菌sigma70启动子在不同基因间的分布.计算了683条大肠杆菌sigma70启动子的每个位点六联体的保守性M6(l)值及涨落限,以大于涨落限7.2的21个保守位点的六联体频数作...
  • 作者: 张杰 张瑞杰 李霞 杨德印 郝大鹏 饶绍奇
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2007年1期
    页码:  15-18
    摘要: 提出了一种新颖的复杂疾病驱使的融合SDA-SVM(Stepwise Discriminant Analysis -Support Vector Machine,SDA-SVM)技术的集成基因...
  • 作者: 于淑惠 杨应斌 袁可
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2007年1期
    页码:  19-22
    摘要: 蛋白质二级结构的预测可以采用建立数学模型,利用计算机来预测问题的解,然后再通过生物学实验来验证,这样可以节约大量的时间和精力,但是数学模型的预测效果如何,相当关键,文章提出基于信息熵的蛋白质...
  • 作者: 杨晶 王兆月 田心
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2007年1期
    页码:  23-24,40
    摘要: 随着生命科学的迅猛发展,生物信息量的急剧增加,大量基因芯片的实验数据是公开发布在Internet网上的,尤其是学术机构在发表论文时所使用的实验数据都可以免费提供给研究人员下载使用.如何能有效...
  • 作者: 张振慧 王勇献 王正华 王秀鹤
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2007年1期
    页码:  25-27
    摘要: 从蛋白质序列出发,采用分组重量编码(Encoding Based on Grouped Weight,简记EBGW),并结合最近邻居算法对蛋白质功能进行预测.对酵母(Saccharomyce...
  • 作者: 张细权 饶友生
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2007年1期
    页码:  28-30
    摘要: dbSNP数据库为广大研究者提供了丰富的SNPs信息,充分地利用dbSNP数据库中的资源将大幅度降低研究成本提高研究效率.结合本实验室的研究工作,对鸡dbSNP数据库的检索和应用进行了一些探...
  • 作者: 吴韶平 张传富 张晓东 彭科峰 曹立群 王立群
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2007年1期
    页码:  31-33
    摘要: 对堆肥微生物种群分布及其动态变化的研究进行了分析,论述了分子生物技术中的变性梯度凝胶电泳和末端标记限制性片段长度多态性的原理和特点,以及用于研究堆肥微生物的群落结构演变规律,为分析和筛选堆肥...
  • 作者: 吴永英 张传富 彭科峰 曹立群 王立群 顾文杰
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2007年1期
    页码:  34-36
    摘要: 主要探讨了近年来微生物纤维素酶的研究进展.重点概述了纤维素酶的分子结构、功能、作用机制以及产纤维素酶微生物种类的研究现状,并对该领域的研究问题和前景进行讨论.
  • 作者: 孙野青 李媛媛 程震龙
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2007年1期
    页码:  37-40
    摘要: 基因组学已经进入到后基因组学时代,破解基因功能是当前的主要任务.生物芯片技术具有高通量,并行性及自动化等特点,将在这一时期发挥重要作用.本文就生物芯片在后基因组学研究中的应用进展,及存在的尚...
  • 作者: 张云 杨宏伟
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2007年1期
    页码:  41-43,48
    摘要: 介绍计算机视觉技术的定义、组成系统和发展状况,总结其在植物学中的应用,指出目前存在的问题以及需要重点解决的关键技术,为今后的深入研究提出了一些建议和方向.
  • 作者: 仇有文 姜天瑞
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2007年1期
    页码:  44-45
    摘要: 中药不良反应是当今人们关注的热点问题之一,我国目前对如何正确应对中药不良反应没有制定一种切实可行的措施.中药不良反应的发生直接关系着中药安全性的评价,对中医药的生存和发展事关重大.概括论述了...
  • 作者: 韩毅强 高亚梅
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2007年1期
    页码:  46-48
    摘要: 针对生物信息学本科教学中的教学方法、实验教学、考核办法以及如何与现代教育技术相结合进行了初步的探索,并对如何提高教学效果培养跨学科的生物信息学人才做了深入思考.
  • 作者: 张振慧 王勇献 王正华
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2007年2期
    页码:  49-52
    摘要: 基于最近邻居算法,从蛋白质一级序列出发,利用蛋白质序列氨基酸组成、二肽组成以及混合组成方法对蛋白质单聚体、二聚体、三聚体、四聚体、五聚体、六聚体和八聚体进行分类研究.结果表明:采用二肽组成编...
  • 作者: 丁晓芳 李红钢 熊承良 熊锦文 田永红 黄东晖
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2007年2期
    页码:  53-57
    摘要: 设计用于SYBR Green I法实时定量逆转录多聚酶链反应(QRT-PCR)检测大鼠尿激酶型纤溶酶原激活因子(uPA)mRNA的引物.从基因库获取靶基因及相关序列,充分收集和分析相关生物信...
  • 作者: 裘智勇 许光志 郭锡杰
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2007年2期
    页码:  58-61,66
    摘要: 运用生物信息学方法将家蚕浓核病毒中国(镇江)株的结构蛋白与其它类型家蚕浓核病毒的结构蛋白在理化特性、结构、功能等方面进行了比较分析.结果表明:家蚕浓核病毒结构蛋白是一类稳定的亲水性蛋白,Bm...
  • 作者: 吕鸣 张晓东 张治洲 潘家奎 胡钧
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2007年2期
    页码:  62-66
    摘要: 在原有的生物大分子序列比对算法的基础上,结合图论中的关键路径法,提出了一种新的计算两寡核苷酸序列间最大配对程度的算法.采用此算法结合生成并测试的方法,能够寻找给定长度的一组适用于DNA计算的...
  • 作者: 张鑫 樊建峰 马学良
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2007年2期
    页码:  67-69
    摘要: 主要介绍了如何使用面向对象技术对红籽瓜数量性状分析软件的设计,阐述了软件的设计过程,代码的编写,实现了对红籽瓜数量性状的分析.
  • 作者: 刘景晶 李文佳 杨欣
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2007年2期
    页码:  70-73
    摘要: 简要地介绍了表面呈现技术和组合酶技术的应用以及发展前景,描述了一种应用分子建模系统辅助进行抗动脉粥样硬化的嵌合酶疫苗的构建过程.门冬酰胺酶活力测定结果证明,嵌合酶的空间结构和活性位点均能够依...
  • 作者: 周猛 施季森 童春发
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2007年2期
    页码:  74-77
    摘要: 利用Phred/Phrap/Consed、cross.match、RepeatMasker、Blast等软件和自主开发程序,基于Linux操作系统,构建了林木EST序列分析系统,完成了从测序...
  • 作者: 李光 李霞 王亚东 苏小红
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2007年2期
    页码:  78-81
    摘要: DNALA是一种个人DNA数据隐私保护的方法.该方法能有效的实现对个人DNA数据的隐私保护,但前期数据预处理复杂,而且后期处理精度不高.本文针对DNALA的这些缺点进行改进,形成了Savio...
  • 作者: 张振慧 王勇献 王正华
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2007年2期
    页码:  82-85,89
    摘要: 蛋白质序列的编码是亚细胞定位预测问题中的关键技术之一.该文较为详细地介绍了目前已有的蛋白质序列编码算法;并指出了序列编码中存在的一些问题及可能的发展方向.
  • 作者: 伍宁丰 刘代成 杨雅婷
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2007年2期
    页码:  86-89
    摘要: 环境中约99.8%的微生物不能用常规的微生物学方法培养,这样就使得绝大部分微生物资源的开发利用受到制约,而宏基因组克隆技术的产生则克服了对不可培养微生物研究的困难.到目前为止,通过宏基因组克...
  • 作者: 冯团诚 庄南生
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2007年2期
    页码:  90-93
    摘要: 虚拟细胞是20世纪末在国外兴起的一种利用现代信息技术和计算机模拟进行细胞研究的全新手段.主要是通过计算机建立人工细胞模型,模拟细胞内外环境,进行生物学的研究和探索.综述了国外主要的虚拟细胞模...
  • 作者: 吴永英 孙文 王立群 肖维伟 顾文杰
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2007年2期
    页码:  94-96
    摘要: 为了实现基因组中特定基因功能的的分析,进一步来推断目的基因的功能.在此主要对基因组水平的基因挖掘与功能分析方法及其研究进展进行了探讨.
  • 作者: 刘宁 张昆 金明杰 韦萍 高振 黄和
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2007年3期
    页码:  97-101
    摘要: 利用Modeller7v7软件对米根霉(Rhizopus oryzae)富马酸酶(fumarase)进行了三级结构的同源建模并对结果的空间和能量上的合理性进行了验证,进一步对酶的结构域和催化...
  • 作者: 刘洪斌 张泽 武伟 鲁成
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2007年3期
    页码:  102-105
    摘要: 利用93个节肢动物线粒体基因组数据,分析了线粒体基因组的碱基组成,及对氨基酸组成的影响.研究表明:(1)节肢动物线粒体基因组GC含量较低,分布范围较窄(13.28%~39.64%).基因组G...
  • 作者: 丁彦蕊 孙俊 蔡宇杰 须文波
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2007年3期
    页码:  106-108
    摘要: 挑选了NCBI COG数据库中具有全基因组的单细胞微生物,选择其中三维结构已知的蛋白质作为研究对象,研究了不同类型的二级结构含量和长度对古细菌和细菌类蛋白质耐热性的影响作用.结果表明:耐热的...

生物信息学基本信息

刊名 生物信息学 主编 任南琪
曾用名
主办单位 哈尔滨工业大学  主管单位 中华人民共和国工业和信息化部
出版周期 季刊 语种
chi
ISSN 1672-5565 CN 23-1513/Q
邮编 150001 电子邮箱 itgene@sohu.com
电话 0451-86414135;0451-86417711(吴永英) 网址 http://swxxx.alljournals.cn/ch/index.aspx
地址 黑龙江省哈尔滨市西大直街92号哈尔滨工业大学邵逸夫科学馆一楼

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