生物信息学期刊
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生物信息学

China Journal of Bioinformatics

CSTPCD

影响因子 0.3945
本刊是由哈尔滨工业大学主办的生物信息及相关领域的国内外公开发行的学术刊物,报道我国生物信息技术研究开发的重要成果和国内外生物信息技术及其产业化最新进展。
主办单位:
哈尔滨工业大学
ISSN:
1672-5565
CN:
23-1513/Q
出版周期:
季刊
邮编:
150001
地址:
黑龙江省哈尔滨市西大直街92号哈尔滨工业大学邵逸夫科学馆一楼
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  • 作者: 余雳 刘谦 廖银萍 李安安 白雪岭 龚辉
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2008年1期
    页码:  1-2,34
    摘要: 利用冰冻铣切技术获取的大鼠腹部的断面图像,构建了大鼠肠道系统的高分辨解剖数据集及三维模型,该数据集及模型具有信息丰富等特点.本工作为开展高等动物肠道系统功能与结构关系的"定量研究及系统整合"...
  • 作者: 刘波 张利绒 晋宏营 罗辽复
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2008年1期
    页码:  3-5,11
    摘要: 对Alu剪接位点双碱基的类型、分布进行了分析,发现非标准剪接(不满足GT-AG规则)占很大优势.而且非标准剪接的分布频率会随不同的染色体而变化,在Alu剪接较多的11、12、17号染色体上分...
  • 作者: 宣劲松 张冰君
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2008年1期
    页码:  6-8
    摘要: 利用日本DDBJ数据库电子克隆了条斑紫菜的6-磷酸海藻糖合成酶基因(pytps),得到全长cDNA序列2727bp;经过ORFfinder分析,获得了相应蛋白质的全长序列908An,分子量约...
  • 作者: 姚晨 彭春方 朱晶 李永进 杨达 王栋 王靖 肖国华 郭政
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2008年1期
    页码:  9-11
    摘要: 采用基因表达谱可以研究基因功能模块与疾病异质性之间的关系.根据两套白血病基因表达谱数据,将富集高变异基因的Gene Ontology基因功能模块作为特征功能模块,将疾病样本聚为两类.通过对比...
  • 作者: 宋东光 陈小英
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2008年1期
    页码:  12-13
    摘要: 利用Linux操作系统的文本过滤技术对通过关键词检索提取NCBI网络数据库的核酸序列和Medline论文摘要快速建立了5种主要植物即拟南芥菜、水稻、玉米、小麦、马铃薯的编码mRNA序列和论文...
  • 作者: 冯付军 唐春娟 李祥龙 王建涛 王海亮
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2008年1期
    页码:  14-17,27
    摘要: 利用生物信息学方法,对GeneBank中截至2006年9月收录的全部来源于山羊基因的共计637条表达序列标签(EST)进行了综合及分类分析.结果显示,在来源于绒山羊舍毛囊皮肤的392条EST...
  • 作者: 于歆 史淑芝 崔杰 徐德昌 程大友 鲁兆新
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2008年1期
    页码:  18-21
    摘要: 作物育种必须调查植物学性状和生物学特征指标数据,来建立种质资源库,利用SPSS多元分析方法克服了传统植物学性状和生物学特征指标难以综合评价的缺陷,探讨利用SPSS统计分析软件对双丰系列甜菜品...
  • 作者: 胡桂武
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2008年1期
    页码:  22-24
    摘要: 将粒子群优化算法应用于序列联配,提出了一种改进的粒子群优化算法,该算法在粒子群的进化过程中根据粒子的适应值动态地调整粒子群的惯性权重与粒子群飞行速度范围,提高了算法的收敛速度和收敛精度;针对...
  • 作者: 李前忠 林昊
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2008年1期
    页码:  25-27
    摘要: 基于果蝇polⅡ启动子的序列特征,利用结合了离散增量和位置权重矩阵的贝叶斯判别函数对果蝇启动子进行了预测.对预测算法进行10交叉检验.通过比较不同大小训练集对结果的影响,说明了参数选取的合理...
  • 作者: 刘融 周艳红 王兰
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2008年1期
    页码:  28-30
    摘要: 基于多个结构域联合作用导致蛋白质间相互作用的假设,提出了一种预测蛋白质间相互作用的新方法.使用支持向量机分析结构域组合对序列的氨基酸理化性质得到其序列特征值,同时采用统计分析的方法获取其频率...
  • 作者: 张纪阳 朱云平 谢红卫 贺福初
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2008年1期
    页码:  31-34
    摘要: 离子阱串联质谱仪是蛋白质组研究中一种高通量,高灵敏度的分析仪器.目前对影响离子阱质谱仪质荷比测量误差的因素和数据产出后系统误差的校正方法还没有系统的分析.利用两批蛋白质标准品的数据和统计方法...
  • 作者: 付新荣 张宏远 李德红 赵丹丹
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2008年1期
    页码:  35-37,42
    摘要: 基因芯片数据在本质上是非线性的,因此用线性数据分析方法处理基因芯片数据将不可避免的会带来偏差.全面分析非线性降维方法(Isomap)的技术特点以及将其应用到基因芯片数据分析中所需要注意的事项...
  • 作者: 孙野青 程震龙 马袁君
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2008年1期
    页码:  38-39,48
    摘要: 随着基因组学和蛋白质组学的发展,生物信息学在数据处理中的应用已经越来越广泛.作为数据处理中越来越重要的分析手段,蛋白质组学数据库是蛋白质组学的主要内容之一.本文分别从生物信息学的蛋白质双向电...
  • 作者: 向文胜 张辉 王艳艳
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2008年1期
    页码:  40-42
    摘要: 简单介绍了PCR-SSCP技术的原理、方法、特点,并阐述了其在植物研究中的应用及发展前景.
  • 作者: 周猛 施季森 童春发
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2008年1期
    页码:  43-45
    摘要: Bioperl是Perl语言专门用于生物信息的工具与函数模块集,是世界各地的Perl开发人员在生物信息学、基因组学以及其他生命科学领域的智能结晶,服务于研究生物学问题的生物学家或计算机专家....
  • 作者: 吴永英 李铁强 王立群 范洪臣
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2008年1期
    页码:  46-48
    摘要: 综述了酵母双杂交技术的基本原理和实际应用,以及该技术的发展,并展望了该系统的发展前景.
  • 作者: 李崇前 李强 杨达 王晨光 肖会 赵丽娜 郝晓峰 郭政 钟国才 马国才
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2008年2期
    页码:  49-51
    摘要: 由基因芯片检测正常大鼠、模型大鼠和服用安佳欣胶囊进行治疗后的大鼠各8例的基因表达谱,在正常组和模型组之间,筛选得到207个差异表达基因和25个差异表达基因功能模块,在模型组和给药组之间,筛选...
  • 作者: 刘红林 周波 王林云 黄瑞华
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2008年2期
    页码:  52-54
    摘要: 对Genbank中猪的白细胞抗原(SLA)Ⅱ类抗原基因DQB及DRB序列进行了SNP及氨基酸序列多态性分析,并对SLA-DQB及DRB分子进行了蛋白质序列模式分析(Prostie motif...
  • 作者: 张久刚 闫艳春
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2008年2期
    页码:  55-58
    摘要: 从农药厂污水处理池中分离得到一株氯氰菊酯降解菌,在30℃,pH 7.0的条件下,无机盐培养基中100mg/L的氯氰菊酯,经过7.5天,能够降解大约52.3%,外加碳源能够明显提高其降解性能....
  • 作者: 字向东 杨其沅 陈琛 马吉云
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2008年2期
    页码:  59-61
    摘要: 对牦牛SRY和TRO的部分基因克隆和序列分析,以期为进一步开展该基因与其性别相关分析,进行性染色体的基因定位、以及分子标记辅助选择等研究提供了理论依据.用特定引物对牦牛和西门塔尔牛的SRY、...
  • 作者: 周猛 施季森 杨立伟 洑香香 王桂凤 童春发
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2008年2期
    页码:  62-64,74
    摘要: 利用生物信息学方法分析了杉木CCoAOMT蛋白的氨基酸组成、等电点、疏水/亲水区、二级结构等蛋白质性质,并同欧洲云杉、拟南芥和水稻的蛋白进行了对比,并用生物信息学软件对其空间结构进行了模拟,...
  • 作者: 张涛涛 邹权 郭茂祖
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2008年2期
    页码:  65-67,84
    摘要: 序列比对是生物信息学中的一项重要任务,通过序列比对可以发现生物序列中的功能、结构和进化的信息.序列比对结果的生物学意义与所选择的匹配、不匹配、插入和删除以及空隙的罚分函数密切相关.现介绍一种...
  • 作者: 何东 周到 周艳红
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2008年2期
    页码:  68-70
    摘要: 根据周期表达基因的周期性和峰值特点,提出了一种将microarray时序表达数据划分为若干个基因表达周期,并对周期内的峰值特点进行评估以识别周期表达基因的方法,能有效减小microarray...
  • 作者: 李凤兰 蒋湘宁 覃拥 陈雪梅
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2008年2期
    页码:  71-74
    摘要: 根据细胞信号转导的特点,利用计算机通信技术,提出了一个类似Internet的细胞信号转导计算机网络模型,对该模型的信息编码提出了自己的规则.并利用此模型对Grill等提出的ABA对气孔运动调...
  • 作者: 印遇龙 孔祥峰 徐海军 黄瑞林
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2008年2期
    页码:  75-79
    摘要: 尽快破解基因组所包含基因的功能是一项费力但又很重要的工作.一个基因功能的实现依赖于该基因与其它基因间的相互作用.基因网络是一组基因的集合体,这些基因通过相互协作来控制生物体重要的生命过程.通...
  • 作者: 张剑峰 徐永安 曹永忠 赵友杰 陆王红
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2008年2期
    页码:  80-81,89
    摘要: 随着Z曲线的提出,用几何学的方法研究DNA序列得到了发展.利用Z曲线的思想对核酸序列的可视化分析平台的构建进行了研究,提出了基于包围盒的多精度抽稀算法,实现了从DNA序列到三维空间点和曲线的...
  • 作者: 周春光 孙平平 崔颖 陆林英 马志强 马雅楠 魏雅卓
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2008年2期
    页码:  82-84
    摘要: 简要介绍了系统发育谱法的原理,着重阐述了K-mean聚类算法在对基因系统发育谱分析中的改进,并与传统的K-mean聚类算法进行比较.实验结果表明,改进的K-mean聚类算法在运用系统发育谱法...
  • 作者: 崔艳华 徐德昌 曲晓军
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2008年2期
    页码:  85-89
    摘要: 乳酸菌广泛应用于食品发酵工业中,其中有些菌种是重要的益生菌.目前,对乳酸菌的研究已从最初的形态学研究进入到了分子水平的研究.乳酸菌全基因组测序研究已在全球展开.乳酸菌基因组研究有助于揭示乳酸...
  • 作者: 宋凯 李霞
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2008年2期
    页码:  90-92,96
    摘要: 代谢组学是后基因时代新兴的一门研究生物体内所有小分子代谢物的组学学科,是系统生物学的有机组成部分.由于代谢组学是基于数据驱动的学科,因此如何有效利用数据预处理、模式识别等信息处理技术从代谢组...
  • 作者: 徐德昌 赵宏璐 高鑫
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2008年2期
    页码:  93-96
    摘要: 量子化学的方法对生物分子研究的发展提供了全新的思路和方法.本文介绍了量子化学的基本计算方法,并综述了近两年来量子化学方法在生物分子领域的研究进展.

生物信息学基本信息

刊名 生物信息学 主编 任南琪
曾用名
主办单位 哈尔滨工业大学  主管单位 中华人民共和国工业和信息化部
出版周期 季刊 语种
chi
ISSN 1672-5565 CN 23-1513/Q
邮编 150001 电子邮箱 itgene@sohu.com
电话 0451-86414135;0451-86417711(吴永英) 网址 http://swxxx.alljournals.cn/ch/index.aspx
地址 黑龙江省哈尔滨市西大直街92号哈尔滨工业大学邵逸夫科学馆一楼

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