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生物信息学
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China Journal of Bioinformatics
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本刊是由哈尔滨工业大学主办的生物信息及相关领域的国内外公开发行的学术刊物，报道我国生物信息技术研究开发的重要成果和国内外生物信息技术及其产业化最新进展。
主办单位：
哈尔滨工业大学
ISSN：
1672-5565
CN：
23-1513/Q
出版周期：
季刊
邮编：
150001
地址：
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1. 基因网络相继故障机理分析刊名： 生物信息学发表期刊： 2013年1期页码:摘要： 癌相关基因在疾病发生与发展过程中的作用机理是非常重要的研究课题.现代数据分析方法,为从基因组数据中推断癌相关基因之间的关联,以及分析基因组的作用机理提供了有效的手段.本文根据基因表达谱数据分...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2013年1期页码:摘要： 本文在引入近似度等概念的基础上,构造了频繁近似模式,并证明了相关性质,同时提出了相应的频繁近似模式的挖掘算法(SFAP)算法.实验结果表明该算法能有效挖掘DNA序列中的频繁近似模式,DNA序...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2013年1期页码:摘要： 基于模板的模建方法是蛋白质结构预测领域中最为准确有效的方法,该类方法的成功与否对模板质量的要求较高.为待预测序列找寻合适的模板,本文提出了一种profile-profile比对的方法将查询序...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2013年1期页码:摘要： 统计有效能函数(Statistical effective energy function (SEEF))又称统计势能函数,来源于对已知蛋白质结构数据库进行的统计分析.近年来Dehouck-...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2013年1期页码:摘要： 影响因子不仅是期刊影响力和有用性的重要指标,而且往往是科研工作者选择拟投稿期刊时所关注的重要因素之一.随着目前国际期刊数量的迅猛增长,影响因子的快速查询便成为一项重要工作.本文在传统的查询检...
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6. 蛋白质功能预测方法概述刊名： 生物信息学发表期刊： 2013年1期页码:摘要： 蛋白质是生物体内最必需也是最通用的大分子,对它们功能的认识对于科学领域和农业领域的发展有着至关重要的作用.随着后基因组时代的发展,NCBI数据库中迅速涌现出大量不明结构与功能的蛋白质序列,这...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2013年1期页码:摘要： 本文以人腺病毒B亚种31条基因组序列及D亚种39条基因组序列为研究材料,利用Imperfect Microsatellite Extractor 和DNAMAN软件对这些基因组序列中简单重复...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2013年1期页码:摘要： 蛋白质分子进化规律研究是分子进化研究的重点,对揭示生命起源与进化机制有重要意义.本文对已知空间结构及物种信息的单绕蛋白,利用结构比对信息,构建了不同层次单绕样本系统聚类图.分析发现:功能相似...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2013年1期页码:摘要： 肉桂酰辅酶A还原酶(Cinnamoyl-CoA reductase,CCR)是催化木质素特异途径的第一个关键酶,是调节碳素流向木质素潜在的控制关节点,对木质素单体的生物合成起着重要作用.通过...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2013年1期页码:摘要： 东方肉座菌EU7-22具有高产半纤维素酶的能力.根据已报道的同属里氏木霉及绿色木霉木聚糖酶,木糖苷酶相关基因序列,设计PCR引物扩增出东方肉座菌内切木聚糖酶(XYN Ⅰ,XYNⅡ)及β-木糖...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2013年1期页码:摘要： 研究家蝇小热休克蛋白sHsp20.6的生物学功能.方法应用生物信息学的方法和工具对家蝇sHsp20.6的理化性质、疏水性、跨膜区和信号肽、膜体分析、二级结构功能域、蛋白质的功能分类预测、多重...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2013年1期页码:摘要： 基于基因表达谱的肿瘤分类信息基因选取是发现肿瘤特异表达基因、探索肿瘤基因表达模式的重要手段.借助由基因表达谱获得的分类信息进行肿瘤诊断是当今生物信息学领域中的一个重要研究方向,有望成为临床医...
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13. 类群特异性PCR引物设计与评估刊名： 生物信息学发表期刊： 2013年2期页码:摘要： 本文以真核藻类18S rDNA类群特异性PCR引物的设计与评估为例,详细介绍了如何利用Primrose等一系列程序设计类群特异性PCR引物并评估其敏感性与特异性,并对这一方法的优势与应用类群...
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14. 基于序列疏水值震荡的折叠速率预测刊名： 生物信息学发表期刊： 2013年2期页码:摘要： 蛋白质折叠速率的正确预测对理解蛋白质的折叠机理非常重要.本文从伪氨基酸组成的方法出发,提出利用序列疏水值震荡的方法来提取蛋白质氨基酸的序列顺序信息,建立线性回归模进行折叠速率预测.该方法不需...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2013年2期页码:摘要： 应用电子克隆技术,以水稻EF576477序列为探针,获得了甘蔗天冬氨酰半醛脱氢酶基因(aspartate-semialdehyde dehy-drogenase,ASADH)的一条cDNA全...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2013年2期页码:摘要： 随着越来越多基因组的测序完成,基于全基因组的非比对的系统发生分析已成为研究热点.不同的生物物种或个体基因组之间的核酸组分不完全相同.遗传语言-DNA序列的信息很大程度上反映在其k-mer频数...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2013年2期页码:摘要： 基于Make2D-DB Ⅱ软件包构建了一个水稻二维电泳-质谱联动数据库Rice2DDB,介绍了该数据库的构建方法和步骤,为快速发展的水稻蛋白质组学研究提供了数据管理和交流的平台,对其他物种的...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2013年2期页码:摘要： 根据已克隆的内切几丁质酶基因序列的同源性比较,设计引物,采用PCR技术从绿色木霉基因组中分离出一个大小为1467bp的特异DNA片段,采用RT-PCR技术从绿色木霉总RNA中分离出大小约1 ...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2013年2期页码:摘要： 序列比对是生物信息学中最常用和最经典的研究手段.生物序列比对需要有强大计算能力的硬件支撑,而近年快速发展起来的GPGPU正好可堪此任.本文首先介绍GPGPU的发展过程,进而讲述GPGPU硬件...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2013年2期页码:摘要： 为了探讨大米蛋白对成熟期大鼠胆固醇代谢调控因子-低密度脂蛋白受体(low-density lipoprorein receptor,LDLR)的调控作用,以18周龄雄性Wistar成熟期大鼠...
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21. 枯草杆菌蛋白耐热性改造区域的识别刊名： 生物信息学发表期刊： 2013年2期页码:摘要： 热稳定性相关区域的识别是蛋白耐热性改造的关键问题之一.本文以枯草杆菌蛋白(SUBTILISIN BPN('))为研究对象,通过枯草杆菌蛋白同源家族序列的统计耦联分析,提取枯草杆菌蛋白中的保守...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2013年2期页码:摘要： 运用同源模建的方法构建了pACY1三维结构模型,并在能量最小化后对模型进行分子动力学模拟和结构合理性评估.同源模建生成了50个原始模型,经过PROCHECK评测后,筛选出模型A、B进行能量最...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2013年2期页码:摘要： 应用生物信息学方法分析肝移植临床耐受患者PBMC基因表达特征,筛选临床耐受关键基因.从GEO数据库获取19个肝移植临床耐受病例及22个非临床耐受病例基因表达谱数据.应用DAVID网络软件进行...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2013年2期页码:摘要： 借助DNA序列中k-字的频数,将序列转化成一个340维向量,进而计算物种间的进化距离.作为应用:分别以15个物种的β球蛋白基因、13种汉坦病毒的S片段以及26个闭壳龟线粒体基因为例,构建系统...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2013年2期页码:摘要： 采用结构方程混合模型(SEMM)对实际SNP数据进行分析,为遗传统计学提供一种新的有效的分析方法.本研究的数据是由GAW17提供的,包含697个个体的22条常染色体的上万个SNP和根据这些S...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2013年2期页码:摘要： 在利用核小体定位实验数据训练支持向量机(SVM)对任意酵母DNA序列的核小体形成能力进行预测的过程中,发现染色质结构对基因组DNA分子进化过程有着显著影响.我们观察到核小体DNA比连接DNA...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2013年2期页码:摘要： 生物体有部分基因被转录成RNA,但是不编码相应蛋白质,称为长链非编码RNA(IncRNA).它们参与基因的表观调控,这一过程对动物、植物的生长发育都有重要作用,但是,目前植物中发现和研究的I...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2013年2期页码:摘要： 目前在众多的分子马达中对骨骼肌肌球蛋白的研究较多,本文对肌球蛋白的结构、工作循环机制以及单分子动力学性质进行了探索.同时,对各种生化条件下肌纤维的收缩性质进行了测试.将Houdusse和Sw...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2013年3期页码:摘要： 基因芯片技术的发展为生物信息学带来了机遇,使在基因表达水平上进行癌症诊断成为可能.但基因芯片数据高维小样本的特征也使传统机器学习方法面临挑战.本文利用真实的基因表达数据,测试了目前主要的分类...
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刊名： 生物信息学发表期刊： 2013年3期页码:摘要： 分子伴侣Hsp40是一种以二聚体的形式调控非天然多肽折叠的热激蛋白.本文通过拉伸分子动力学研究了酵母Hsp40家族成员Ydj1p二聚体中β14～β15与domain-Ⅲ的分离过程,深入探讨了...
生物信息学基本信息
| 刊名 | 生物信息学 | 主编 | 任南琪 |
| 曾用名 | |||
| 主办单位 | 哈尔滨工业大学 | 主管单位 | 中华人民共和国工业和信息化部 |
| 出版周期 | 季刊 | 语种 |
chi
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| ISSN | 1672-5565 | CN | 23-1513/Q |
| 邮编 | 150001 | 电子邮箱 | itgene@sohu.com |
| 电话 | 0451-86414135；0451-86417711（吴永英） | 网址 | http://swxxx.alljournals.cn/ch/index.aspx |
| 地址 | 黑龙江省哈尔滨市西大直街92号哈尔滨工业大学邵逸夫科学馆一楼 |
生物信息学评价信息
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