生物信息学期刊
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生物信息学

China Journal of Bioinformatics

CSTPCD

影响因子 0.3945
本刊是由哈尔滨工业大学主办的生物信息及相关领域的国内外公开发行的学术刊物,报道我国生物信息技术研究开发的重要成果和国内外生物信息技术及其产业化最新进展。
主办单位:
哈尔滨工业大学
ISSN:
1672-5565
CN:
23-1513/Q
出版周期:
季刊
邮编:
150001
地址:
黑龙江省哈尔滨市西大直街92号哈尔滨工业大学邵逸夫科学馆一楼
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  • 作者: 罗辽复
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2014年1期
    页码:  1-4
    摘要: 本文评述了理论生物学的两个基础实验.一是用离子束辐照加速大肠杆菌进化的方法研究原核基因组的进化方向,证明进化中的缺失偏好性和编码信息量扩增律不矛盾.二是提出用导热法测量细胞的熵产生,比较研究...
  • 作者: 管瑞 高敬阳 齐飞
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2014年1期
    页码:  5-9
    摘要: 基因组结构变异的检测是生物信息学的重要方向之一.本文分别对基于高通量测序技术的双末端映射方法、映射分布方法、分裂片段方法和序列拼接方法等检测技术的四种算法进行详细的解读和说明,阐述了以上四种...
  • 作者: 张玉叶 罗俊 肖新换 苏炜华 阙友雄 黄宁 黄珑
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2014年1期
    页码:  10-17
    摘要: 以甘蔗类似细胞色素C的EST序列CF576943.1为探针,通过电子克隆技术获得了甘蔗细胞色素C基因(Cytochrome C,Cyt C)的一条cDNA全长序列,命名为ScCyt C.用生...
  • 作者: 张富春 普燕 杨艺
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2014年1期
    页码:  18-26
    摘要: 通过生物信息学的方法对双峰驼凝乳酶原基因及相应的氨基酸序列的同源性、理化性质、保守结构域、亚细胞定位、信号肽、跨膜结构域、亲水性/疏水性、二级结构进行预测分析.结果表明,双峰驼凝乳酶原基因开...
  • 作者: 姬可平 牛宪立 许朋
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2014年1期
    页码:  27-32
    摘要: 以改进的CTAB法对何首乌总基因组DNA进行提取,采用通用引物对不同来源的何首乌rDNA ITS序列进行PCR扩增、测序和序列分析.结果表明,何首乌rDNA完全序列片段长度共约652 bp,...
  • 作者: 王智
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2014年1期
    页码:  33-37
    摘要: 协同系统发生研究生态上相关群体的系统发生间的关系,其研究方法主要分为两类:基于事件法和整体拟合法.基于事件法包括布鲁克斯简约分析、组分分析、协调树分析等,此类方法考虑进化情境,逻辑性强,但分...
  • 作者: 唐羽 李敏
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2014年1期
    页码:  38-45
    摘要: 蛋白质网络聚类是识别功能模块的重要手段,不仅有利于理解生物系统的组织结构,对预测蛋白质功能也具有重要的意义.聚类结果的可视化分析是实现蛋白质网络聚类的有效途径.本论文基于开源的Cytosca...
  • 作者: 宋茂海 李东方
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2014年1期
    页码:  46-52
    摘要: 利用共词分析和可视化方法对生物信息学的关键词进行聚类分析,探讨该研究领域的学科分类和热点内容.以中国知网、中华医学会数据库中期刊论文为统计来源,对1998~2013年间的5 707篇生物信息...
  • 作者: 杨龙成 陆继庆
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2014年1期
    页码:  53-59
    摘要: 为了进一步探索经颅磁刺激工作机理并改进或研制出新的经颅磁刺激激励源.本文从经颅磁刺激的原理推导出了磁场、感应电流及激励源原理电路电流的表达式,利用大脑-线圈和大脑-线圈-铁芯两种经颅磁刺激模...
  • 作者: 关鹏 杜志成 黄德生
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2014年1期
    页码:  60-64
    摘要: 基于结核分枝杆菌国际标准强毒株H37Rv菌株的基因组尺度代谢网络模型iNJ661进行分析,以寻找代谢网络中培养基的关键成分和必要基因.该研究在Matlab平台上利用COBRA工具箱,采用基于...
  • 作者: 张静 杨敏
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2014年1期
    页码:  65-71
    摘要: 转录调控是基因表达调控的主要过程,而转录调控模体使用的差异性可能是导致基因组织特异性的因素之一.本文提出一种不同组织基因调控差异性的统计分析方法,首先结合泊松分布和主成分分析提取基因启动子中...
  • 作者: 刘洪波 张岩 王心宇 王芳 苏建忠 许颖出
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2014年1期
    页码:  72-76
    摘要: DNA甲基化作为一种表观遗传学修饰,在调控基因表达、X染色体失活、印记基因等方面都发挥着重要的作用.不同的DNA甲基化的预处理方法结合二代测序产生了大量的高通量甲基化数据,这些数据的存储、处...
  • 作者: 张道远 李小双 高贝
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2014年2期
    页码:  77-83
    摘要: VOZ( Vascular plant One Zinc finger protein)作为与植物的进化与发育密切相关的基因,在极端耐旱荒漠苔藓植物齿肋赤藓( Syntrichia cani...
  • 作者: 李敏 郑瑞清
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2014年2期
    页码:  84-89
    摘要: 关键蛋白质是指那些在蛋白质相互作用网络中承担重要作用、移除后会使蛋白质复合物功能丧失并导致生物无法存活的节点。随着蛋白质数据库的不断完善和高通量技术的发展,使得通过计算方法的关键蛋白预测得到...
  • 作者: 张富春 王艳 贾富强 赵航
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2014年2期
    页码:  90-98
    摘要: 盐穗木是一种理想的耐盐模式植物,本文利用生物信息学方法分析盐穗木在盐胁迫下差异表达基因的转录组,为盐穗木耐盐机理及耐盐关键基因的储备提供理论依据。基于盐穗木在盐胁迫(600 mM NaCl)...
  • 作者: 张玉叶 罗俊 肖新换 苏炜华 阙友雄 黄宁 黄珑
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2014年2期
    页码:  99-105
    摘要: 旨在为甘蔗细胞色素P450还原酶基因的实验克隆、功能鉴定及其应用提供参考。本研究以甘蔗类似细胞色素P450还原酶基因的EST序列CF576130.1为探针,在甘蔗EST数据库中进行检索,并基...
  • 作者: 万苏磊 张林 李琪 汪菲 王雪松 石玥
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2014年2期
    页码:  106-109
    摘要: DNA甲基化作为一种重要的表观遗传修饰,其甲基化水平被发现与疾病的发生发展密切相关,对其进行聚类分析有希望发现新的疾病亚型并建立有效的疾病预测预后方法。传统的聚类分析方法之一模糊C-均值( ...
  • 作者: 周小红 周雷 宋有涛 徐利楠 李辉 薛友林
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2014年2期
    页码:  110-116
    摘要: Hsc70与auxilin蛋白组成的系统是Hsp70/Hsp40分子伴侣系统家族的一员,在热休克反应中发挥重要作用。本文为得出auxilin蛋白J结构域的关键氨基酸,首先采用由二硫键交联的H...
  • 作者: 刘俊 吕红强 张善新 韩九强
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2014年2期
    页码:  117-122
    摘要: 近年来研究证实,人内源性逆转录病毒( HERV)中长末端重复序列( LTR)和囊膜蛋白基因( env)与基因异常表达关系密切。本文阐述了HERV国内外研究现状与发展动态。从生物信息学角度对L...
  • 作者: 李晓琴 王勤 马帅
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2014年2期
    页码:  123-132
    摘要: 蛋白质折叠规律的研究是生命科学重大前沿课题之一,折叠分类是蛋白质折叠研究的基础。本文基于LIFCA数据库,选取样本量大于2的55种α/β类蛋白质折叠类型为研究对象。结合蛋白质折叠类型的定义及...
  • 作者: 封海清 陆祖宏
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2014年2期
    页码:  133-139
    摘要: 传统的DNA序列可视化模型局限于短DNA序列的可视化,并且缺乏对可视化图形的通用分析方法。因此,文章提出了一种基于图像的DNA序列可视化模型,这种模型通过将一维的DNA序列转换为二维的256...
  • 作者: 卢汀
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2014年2期
    页码:  140-144
    摘要: 基因的差异化表达由多种因素共同导致,并且与许多疾病的发生和发展有密切联系,对差异化表达的基因进行生物信息学以及生物统计学的分析对于研究细胞调节机制和疾病机理有着重要意义。目前,对差异化表达的...
  • 作者: 任慧玲 孙奇 陈怡帆
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2014年2期
    页码:  145-150
    摘要: 通过分析国外公众健康信息学研究的年代分布特点、核心期刊、重要作者和研究热点,探索国外公众健康信息学研究的历史、现状和发展趋势,为国内公众健康信息学领域的研究与实践提供理论参考。利用TDA、E...
  • 作者: 刘洪波 崔颖 张岩 王芳 祝让飞 苏建忠
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2014年2期
    页码:  151-156
    摘要: 组蛋白修饰是在基因组水平上起到重要调控作用的表观遗传修饰,随着ChIP-Seq的广泛使用,高通量数据的积累,为从全基因组研究组蛋白修饰模式奠定了基础。但目前缺乏在多样本间筛选疾病相关的调控区...
  • 作者:
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2014年3期
    页码:  156-156
    摘要:
  • 作者:
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2014年3期
    页码:  156-156
    摘要:
  • 作者: 吕强 杨伟
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2014年3期
    页码:  157-161
    摘要: RosettaLigand使用多次启动对接协议的方式对蛋白质-配体复合物构象空间进行采样,在串行或并行的构象搜索实例之间并不共享采样信息。因此并行对接与串行对接相比仅仅是增加了对接的速度,并...
  • 作者: 丰继华 单增辉 单秋甫 卢英 陈攀峰
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2014年3期
    页码:  162-166
    摘要: 在对两种模式生物酵母与果蝇胚胎期核小体定位进行研究时,发现不同物种间以及同一物种中不同表达模式基因上的核小体分布呈现出差显著异性。在总体上,转录起始位点附近的酵母核小体NFR区域比果蝇的NF...
  • 作者: 孙之荣 李文杰
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2014年3期
    页码:  167-170
    摘要: 使用第二代测序数据来发现癌细胞中的基因组突变,一直是很重要的科学应用问题。此研究使用一个癌症病人的大量数据,评估了甄别基因组突变的几个现有工具。经过比较各工具的方法和正确率,本文发现各自都有...
  • 作者: 夏翾 李晓琴 王勤 马帅
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2014年3期
    页码:  171-178
    摘要: 对蛋白质进行嗜热性改造是蛋白质工程的主要问题之一,残基突变方法被广泛运用于其中。本文以枯草杆菌蛋白酶(SUBTILISIN BPN′)为研究对象,旨在建立评判嗜热性改造效果的方法,选取了有可...

生物信息学基本信息

刊名 生物信息学 主编 任南琪
曾用名
主办单位 哈尔滨工业大学  主管单位 中华人民共和国工业和信息化部
出版周期 季刊 语种
chi
ISSN 1672-5565 CN 23-1513/Q
邮编 150001 电子邮箱 itgene@sohu.com
电话 0451-86414135;0451-86417711(吴永英) 网址 http://swxxx.alljournals.cn/ch/index.aspx
地址 黑龙江省哈尔滨市西大直街92号哈尔滨工业大学邵逸夫科学馆一楼

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