生物信息学期刊
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生物信息学

China Journal of Bioinformatics

CSTPCD

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本刊是由哈尔滨工业大学主办的生物信息及相关领域的国内外公开发行的学术刊物,报道我国生物信息技术研究开发的重要成果和国内外生物信息技术及其产业化最新进展。
主办单位:
哈尔滨工业大学
ISSN:
1672-5565
CN:
23-1513/Q
出版周期:
季刊
邮编:
150001
地址:
黑龙江省哈尔滨市西大直街92号哈尔滨工业大学邵逸夫科学馆一楼
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  • 作者: 李慧 杨林
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2018年1期
    页码:  1-6
    摘要: Nrf2是调控细胞氧化应激反应的重要转录因子,同时也是维持细胞内氧化还原稳态的中枢调节者.Nrf2通过诱导调控一系列抗氧化蛋白的组成型和诱导型表达,可以减轻活性氧和亲电体引起的细胞损伤,使细...
  • 作者: ZHENG Jie 何勇群 余红 刘清平 周伟 朱伟民 朱彦 杨啸林 王海河 谢江安 邵晨
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2018年1期
    页码:  7-14
    摘要: 在最近兴起的生物医学大数据和精准医学研究中,本体正发挥着不可替代的作用.但一大部分人对本体的定义、类型与应用比较混淆.这篇综述对这些问题进行了回答.具体而言,本体使用人和计算机都可以理解的术...
  • 作者: 刘安 刘畅
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2018年1期
    页码:  15-21
    摘要: 核糖体蛋白S6激酶β1(Ribosomal protein S6 kinaseβ1,RPS6KB1)是一个有价值的肝癌诊断和预后标志物,也是一个潜在的基因治疗分子靶点,但其致癌机制和预后价值...
  • 作者: 冯庭 司国阳 李国辉 蔡永萍 郭宁
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2018年1期
    页码:  22-28
    摘要: 生长素响应因子(ARF)是植物中可以特异性结合生长素应答基因启动子的转录因子,在植物的生长发育中起着重要的调控作用.为了更好的了解亚洲棉中ARF基因家族的种类和数量,本文利用生物信息学的方法...
  • 作者: 左永春 贾雪琦
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2018年1期
    页码:  29-35
    摘要: DHA和EPA对心脑血管疾病以及癌症等疾病的防治有着重要的作用,其中ω?3和ω?6脂肪酸脱氢酶是合成多不饱和脂肪酸DHA和EPA过程中的两个关键的去不饱和酶,由于缺乏这两种酶的基因,高等动物...
  • 作者: 刘毅慧 张帅燕
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2018年1期
    页码:  36-42
    摘要: 蛋白质二级结构预测是进行蛋白质三级结构研究的重要基础,氨基酸的编码方式对二级结构预测有一定的影响.本文应用了一种新的组合编码方式,即将基团编码与位置特异性打分矩阵(PSSM)进行组合的编码方...
  • 作者: 徐秀林 郑天雷
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2018年1期
    页码:  43-48
    摘要: 为了提高设备利用率,大多医院将部分设备集中放置于病区服务中心,供全院科室共享使用,但是设备的借用、归还登记依然采用手工模式,这种模式工作效率低下且数据统计难度大.为了解决该问题,本文设计开发...
  • 作者: 丁伟 安浩东 王文峰 王春燕 白耀宇 谷立坤
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2018年1期
    页码:  49-56
    摘要: 烟草青枯病为土传病害,病原菌可在土壤中存活较长时间.本文采用含有i?赤藓糖醇、α?环式糊精等15种碳源的培养板,培养青枯病长期高发病烟田土壤样品与不发病烟田土壤样品,寻找青枯病发生土壤碳源代...
  • 作者: 李颖婕 董晓威 赵晶 黄江茵
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2018年1期
    页码:  57-64
    摘要: 膝骨性关节炎是中老年人群中常见的慢性、不可逆关节疾病.为了解决常规的CT扫描、核磁共振成像等检测手段存在的辐射影响较大,无法作为常规体检项目,以及无法检测出早期膝关节内部组织病变等缺点,本文...
  • 作者: 刘宏德 孙啸 徐军 明文龙 李晟 罗幸 谢建明 陆祖宏
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2018年2期
    页码:  65-71
    摘要: 近年来,生物信息学已经逐步发展成为现代生物学和医学等领域的关键技术方法,社会对生物信息学专业人才的需求不断扩大,生物信息学的本科教育也受到了越来越多的关注和重视.为了探索更加合理的人才培养模...
  • 作者: 胡杨
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2018年2期
    页码:  72-75
    摘要: 在教学实践的基础上,结合生物信息学课程的学科特点,以及现代教育技术,就开设生物信息学课程的必要性及构建最合适的复合型教育模式展开了初步的探讨,为我国生物信息学课程的教学实施提供指导.随着时代...
  • 作者: 肖凯 邹任玲
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2018年2期
    页码:  76-82
    摘要: 表面肌电信号(Surface Electromyography,sEMG)是通过相应肌群表面的传感器记录下来的一维时间序列非平稳生物电信号,不但反映了神经肌肉系统活动,对于反映相应动作肢体活...
  • 作者: 王荣春 董宇婷
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2018年2期
    页码:  83-89
    摘要: 糖尿病是一组以高血糖为特征的代谢性疾病,是由于胰岛素分泌缺陷或其生物功能受损,或两者兼有引起.糖尿病可能导致各种组织,特别是眼、肾、心脏、血管、神经的慢性损害、功能障碍.糖尿病主要分为Ⅰ型糖...
  • 作者: 刘雪飞 范磊 黄新河
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2018年2期
    页码:  90-96
    摘要: 多球壳菌素是前期鉴定出的一种抗衰老活性小分子,为了较全面理解多球壳菌素的抗衰机制,本研究利用模式生物芽殖酵母为材料,借助DNA Microarray技术、生物信息学手段并结合相关功能实验分析...
  • 作者: 丁瑞丰 冀雪飞 安美君 徐秀林 胡秀枋
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2018年2期
    页码:  97-104
    摘要: 本研究针对脑卒中偏瘫患者的平衡功能定量评估的需求,设计一种针对坐下站起过程中各阶段平衡功能评估及训练的系统软件,该软件配合坐位站起平衡功能训练仪使用.软件采用面向对象编程技术,应用VS201...
  • 作者: 刘安 刘畅
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2018年2期
    页码:  105-112
    摘要: 针对RIPK4(Receptor?interacting serine/threonine kinase protein 4)结构与功能的报道较少且矛盾.本研究使用生物信息学手段,对RIPK...
  • 作者: 周晶 谢雪英 顾万君
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2018年2期
    页码:  113-118
    摘要: 环状RNA是新发现的一类具有重要生物学功能的RNA.现有的环状RNA识别工具依赖高通量测序数据,因数据本身和识别方式的弊端而普遍存在准确性不足、不同方法间重复性低以及假阳性率/假阴性率高等缺...
  • 作者: 卢博彬 宋东光 陈柳婷
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2018年2期
    页码:  119-129
    摘要: 从RNA?Seq高通量测序短序列进行比对及拼接获得较长转录本并确定基因表达量的方法随着转录组测序的广泛开展仍在不断改进,本文利用类Unix系统的文本处理命令组合对山茶花开花期叶片及花瓣的转录...
  • 作者: 成金勇 王剑 赵志刚 鹿文鹏
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2018年2期
    页码:  130-136
    摘要: 蛋白质结构的预测在理解蛋白质结构组成和蛋白质的生物学功能有重要意义,而蛋白质二级结构预测是蛋白质结构预测的重要环节.当PSSM位置特异性进化矩阵被广泛应用于将蛋白质初级结构序列编码作为输入样...
  • 作者: 徐秀林 王燕
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2018年3期
    页码:  137-142
    摘要: 循环肿瘤细胞(CTCs)对恶性肿瘤传播转移有重要影响,因此CTCs识别技术的出现与不断进步有着重要的临床意义,准确可靠的CTCs识别技术将为尽早确诊肿瘤、指导个性化治疗方案、诊断微小残留病变...
  • 作者: 乔战龙 刘涛 杨静芬 魏志伟
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2018年3期
    页码:  143-147
    摘要: 基因置换,又称基因替代作用,它指的是遗传信息单向的从一个序列向其同源序列传递的过程.近年来,人们对遗传重组的发生机制、功能及影响有了新的认识,尤其是发现"重组"造成的基因置换远超过以前认识....
  • 作者: 刘雪飞 王楠 范磊 黄新河
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2018年3期
    页码:  148-155
    摘要: 芽殖酵母Sch9与哺乳动物S6K1是保守的寿命调控同源蛋白,利用生物信息学手段比较分析了Sch9与S6K1的理化性质、亚细胞定位、信号肽和跨膜区、空间结构、蛋白质相互作用网络、序列同源性及进...
  • 作者: THEKRA Khushafa 刘雪飞 童侨 范磊 黄新河
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2018年3期
    页码:  156-162
    摘要: 寻找抗衰老活性小分子并研究其作用机制是衰老药物学研究的重点和热点.本文报道了一种新的抗衰老活性小分子琥珀酸,发现琥珀酸可以显著延缓芽殖酵母细胞的衰老并增强细胞的压力抗性.随后,利用DNA M...
  • 作者: 刘毅慧 赵咏旺 黄伟
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2018年3期
    页码:  163-169
    摘要: 原发性肝癌(PLC)患者在精确放疗后乙型肝炎病毒(HBV)再激活是一种常见并发症,及时的预测防护能降低发病率、死亡率.研究表明:多余的特征变量会影响HBV再激活的预测精度.通过提出基于近邻成...
  • 作者: 丰磊 吴玲惠 李元 舒青龙
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2018年3期
    页码:  170-177
    摘要: 根据物种学名、分类号、任意一段核酸或蛋白质的序列,判定其属于什么物种及其详细分类的信息如何,是生物信息分析的最为基础且重要的环节,但该过程的分析及结果的获取均为手动,费时费力且容易出错.本研...
  • 作者: 李旭凯 王俊杰 王钇杰
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2018年3期
    页码:  178-183
    摘要: 如何从庞大的基因表达数据库里挖掘出有价值的信息,并做出科学的生物学诠释,是基因表达分析领域的重要挑战.富集分析为解决这一问题提出了合理的方案.用Perl语言写了一个脚本——Enrich_an...
  • 作者: 唐元华 张民霞 雷建强
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2018年3期
    页码:  184-189
    摘要: 全外显子组测序研究已经应用在疾病、药物等方面,是临床研究中一种辅助分子诊断方法.该方法也逐步应用在临床ABO血型的判定中,由于目前临床血型判定的主要方法是血清学,疑难样本判定等问题无法解决,...
  • 作者: 余兰 冯昆 孙智勇 许朋 郑春辉
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2018年3期
    页码:  190-195
    摘要: 针对临床标本基因组DNA的提取方法缺乏广泛适用性,提取步骤繁琐,需要进行离心操作,并且提取过程中会用到苯酚、氯仿等有机试剂,会对操作人员有一定的危害性等不足,本研究拟建立一种适用于临床标本的...
  • 作者: 刘安 刘畅
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2018年3期
    页码:  196-202
    摘要: FOXD3(Forkhead box D3)作为一个有价值的肿瘤预后标志物,其抑癌机制和预后价值仍未被完全阐明.为了全面认识FOXD3,本研究利用生物信息学手段,对FOXD3蛋白的氨基酸序列...
  • 作者: 巩文静 张成岗 李志慧 高大文 高艳
    刊名: 生物信息学
    发表期刊: 2018年4期
    页码:  203-213
    摘要: 达尔文进化论强调了"物竞天择,适者生存"的理念与逻辑,对动物起源与进化提供了重要解释;然而,为什么会有动物、以及为什么会进化出人类等问题,却仍无答案.在我们实验室近年来从事肥胖及相关慢病研究...

生物信息学基本信息

刊名 生物信息学 主编 任南琪
曾用名
主办单位 哈尔滨工业大学  主管单位 中华人民共和国工业和信息化部
出版周期 季刊 语种
chi
ISSN 1672-5565 CN 23-1513/Q
邮编 150001 电子邮箱 itgene@sohu.com
电话 0451-86414135;0451-86417711(吴永英) 网址 http://swxxx.alljournals.cn/ch/index.aspx
地址 黑龙江省哈尔滨市西大直街92号哈尔滨工业大学邵逸夫科学馆一楼

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