药效假说在配体从头设计中的适用性探讨

• 来源期刊: 生物物理学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 药效假说 从头设计 图谱 能量分量RMSD GEHLHAAR势能
• 年，卷（期）: 1999,（4）
• 页码范围: 740-750
• 页数: 11页
• 分类号: Q271
• 语种: 中文

摘要

在基于靶蛋白结构的多肽分子设计中,药效假说是从头设计方法的基本前提.虽然该假说是否成立已有不少议论,但尚未见到系统分析的报道.通过对8 个蛋白质复合物界面做了氨基酸模拟图谱,并从模拟图谱的结构偏差与能量分量的关系,对药效假说的适用条件进行了讨论.同时也给出一个HIV－ 1 蛋白酶及抑制剂复合物的功能图谱.从所得结果来看,药效假说在以氨基酸为药效基团时,尽管不少情况下仍然有效,但不是普遍成立的.