短杆菌肽A-DMPC通道内离子输运的分子动力学模拟

• 作者: 汤宇舟 王存新 陈慰祖
• 来源期刊: 生物物理学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 短杆菌肽A-DMPC通道 离子输运 分子动力学模拟
• 年，卷（期）: 2000,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 569-576
• 页数: 8页
• 分类号: Q61
• 字数: 3939字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-6737.2000.03.020

摘要

用最近提出的构建膜体系初始构象的有效方法,构建了在DMPC脂膜环境下短杆菌肽A通道模型(GA-DMPC).通过对Na+、Ca2+、Cl-三种不同离子在GA-DMPC通道内不同位置的分子动力学模拟,研究离子在通道内输运过程中与通道及通道内水分子的相互作用,从分子动力学的角度阐明离子在通道内的输运机制.主要计算结果表明:(1)离子在通道内的输运使GA的构象发生变化,GA的柔性是离子在通道内通透的重要因素;(2)Cl-离子可扩大通道半径,Na+离子和Ca2+离子则减小通道半径.Cl-离子不能在GA通道内通透;(3)离子的出现使通道内水分子的偶极方向发生变化.上述结果均与实验相符.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈慰祖	北京工业大学生物医学工程中心	59	243	8.0	11.0
2	王存新	北京工业大学生物医学工程中心	82	340	9.0	13.0
3	汤宇舟	中国科学技术大学天文与应用物理系	1	4	1.0	1.0