阿片孤儿受体三维结构的比较分子模拟

• 作者: 嵇汝运 曹阳 朱友成 罗小民 蒋华良 陈凯先 黄小琴
• 来源期刊: 中国药理学报(英文版)
• 关键词: 蛙视紫红质 阿片孤儿受体 模板 分子模型 分子力学
• 年，卷（期）: 2000,（6）
• 所属期刊栏目: 研究原著
• 页码范围: 529-535
• 页数: 7页
• 语种: 英文

摘要

建立阿片孤儿受体(ORL1)的三维结构。方法：以蛙视紫红质为模板，用比较分子模拟方法进行序列联配，建立阿片孤儿受体七段跨膜区的结构；通过自己构件的数据库进行搜寻确立膜外环区的构象；对初始模型进行分子力学优化。结果：建立了阿片孤儿受体的三维结构模型；有多个氢键集中区分别存在于跨膜区和膜外环区；保守性的结合口袋位于第三、五、六、七跨膜区；预测可能的结合位点由包含Asp130、Tyr131残基的高度保守区和靠近膜外端的部分可变区组成。结论：模拟膜外环区的方法可用于其他GPCR的分子模拟；所建立的三维结构模型有助于阿片受体的结构功能研究并能为相关实验提供有益信息。