抗HPV11 E2核酶的计算机设计

• 作者: 侯化 刘德忠 杨光彩 王曙 黄扬中
• 来源期刊: 中国生物化学与分子生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 核酶,计算机设计,HPV11 E2
• 年，卷（期）: 2001,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 766-771
• 页数: 6页
• 分类号: Q522
• 字数: 4816字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-7626.2001.06.018

摘要

借助计算机软件分析,设计出能特异性切割HPV11型644 nt E2 mRNA的核酶(ribozyme).遵循Symon＇s锤头状核酶结构和GUX剪切位点原则,靶序列存在32个这样的剪切位点.通过计算机软件分析出核酶的最佳剪切位点,并对底物及核酶的二级结构进行预测及进行相应基因生物学功能和基因同源性分析,筛选出2个锤头结构核酶.针对这两位点设计的核酶分别命名为RZ2777和RZ3281.计算机分析显示,两核酶与底物切点两翼碱基形成锤头状结构,切点所在基因序列具有相对松弛的二级结构,位于该基因重要生物功能区内,是核酶的理想攻击区域.通过基因库检索,在已知人类基因排除了与上述两核酶切点两翼碱基有基因同源性序列的可能性.将两核酶用于体外剪切实验取得了良好的实验结果,认为借助计算机分析可帮助尽快从多个剪切位点选择出最适核酶.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王曙	复旦大学生命科学学院遗传学研究所	6	4	1.0	1.0
2	杨光彩	广州第一军医大学生化教研室	3	10	2.0	3.0
3	侯化	广州第一军医大学生化教研室	1	2	1.0	1.0
4	黄扬中	美国弗吉尼亚大学生物学系	1	2	1.0	1.0
5	刘德忠	广州第一军医大学生化教研室	1	2	1.0	1.0