PCR产物直接测序还是克隆测序?——密叶杉属rDNA ITS序列的测定方法

• 作者: 李春香 杨群
• 来源期刊: 植物学报
• 关键词: 密叶杉属 ITS 协同进化 PCR产物直接测序 PCR产物克隆测序
• 年，卷（期）: 2002,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 698-704
• 页数: 7页
• 分类号: Q94
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-3466.2002.06.008

摘要

通过PCR产物直接测序和克隆测序对三种密叶杉属(Athrotaxis)植物rDNA内转录间隔区(ITS)及5.8 S rDNA序列进行了测定与分析.实验表明A. selaginoides rDNA重复序列间的纯合程度很高, 对PCR产物直接测序就可以测定其ITS区序列.而A. laxifolia、A. cupressoides的ITS1重复序列间的纯合程度较低,各重复单位间序列存在插入/缺失,只有对PCR产物进行克隆测序才能确定其序列.A. laxifolia、A. cupressoides的ITS2区尽管也存在多态性,但不同重复序列的浓度比较平均,对PCR产物直接测序就可确定重复序列间的变异情况.本实验表明尽管是同一属的三种植物,但其rDNA重复序列间的纯合程度不同,同一植物ITS的不同区域,其重复序列间的纯合程度也不同,针对不同的ITS片段可采用不同的方法以测定其序列.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李春香	中国科学院南京地质古生物研究所	23	306	11.0	17.0
2	杨群	中国科学院南京地质古生物研究所	41	432	12.0	19.0