为了揭示多拷贝基因的进化方式, 对濒危植物木根麦冬(Ophiopogon xylorrhizus Wang et Dai) 3个居群、6个个体的294个5S rR NA 基因拷贝及其姐妹种林生麦冬(O. sylvicola Wang et Tang)的45个拷贝进行了DNA测序和序列分析,并以这个迄今发表的最大的单个物种的5S rRNA基因数据,以PAUP程序重建了分子系统发育树.结果表明: 1)所得序列呈高度多样性,长度变化在307~548碱基之间,仅13对(3.8%)相同,序列分化指数较高:木根麦冬是0.078,林生麦冬是0.032,两物种间是0.149; 2)100%的统计值支持两物种的5S rRNA 基因分别来自于祖先种的一个拷贝,即"建立者拷贝",这个拷贝在物种形成之后进行了一系列连续的扩增,形成一个直系的基因家族,而祖先种的其他拷贝在物种形成后被丢失; 3)不同拷贝是独立进化的,序列间的一致化过程很弱,这在串联重复的rR N A基因中是罕见的; 4)木根麦冬居群间曾存在频繁的基因交流,使5S rRNA 基因的许多拷贝扩散于不同居群,维持着种内较高的遗传多样性.可以认为是某些近期发生的变化,阻止了居群间的基因交流,导致该物种广泛的自交,发生自交衰退,并最后导致濒危.