基于工作站机群的PVM系统的序列比对

• 作者: 刘寿强 吕国斌 墙芳躅 桂兵祥 潘春华
• 来源期刊: 计算机工程
• 学科: 工学
• 关键词: COW PVM Smith-Waterman
• 年，卷（期）: 2002,（5）
• 所属期刊栏目: 软件技术与数据库
• 页码范围: 89-90,96
• 页数: 3页
• 分类号: TP393.09
• 字数: 2030字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-3428.2002.05.034

摘要

序列比对是分子生物学研究领域的一个重要的工具.在DNA数据量急剧增加的今天,高效的序列比对算法在研究新发现的次序中显导非常重要.通过Smith和Waterman法用PVM系统在工作站机群上已完成了分布式序列比对法.也同样在InteriPSC/860高性能并行计算机上获得了成功.这个分布式Smith-Waterman算法在Intemet GRAIL和GENQUEST上充当搜索工具.该文论述了此算法的实现和性能指标.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吕国斌	中国地质大学网络中心	24	140	6.0	10.0
2	潘春华	中国地质大学研究生院	8	157	5.0	8.0
3	墙芳躅	中国地质大学网络中心	11	207	5.0	11.0
4	刘寿强	中国地质大学研究生院	5	48	3.0	5.0
5	桂兵祥	中国地质大学研究生院	2	20	2.0	2.0