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半定量RT-PCR检测胶质瘤细胞分化相关新基因的表达
半定量RT-PCR检测胶质瘤细胞分化相关新基因的表达
作者:
兰青
孙继勇
王爱东
董军
黄强
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
胶质瘤
基因表达谱
生物信息学
RT-PCR
摘要:
背景与目的:利用基因芯片和生物信息学手段从大量的基因中筛选肿瘤发生发展过程中重要的调控基因,是目前功能基因组研究的一个重要研究方向.但是小样本量的检测有时会出现一些假阳性和假阴性结果,因此很有必要抽取部分样本的基因进行验证.本文利用半定量RT-PCR检测了从胶质瘤恶性进展和诱导分化两个基因表达谱中利用生物芯片和生物信息学技术筛选出来的7条基因在胶质瘤组织中的表达情况,目的在于,一方面验证以前的基因芯片数据的可靠性;另一方面通过对基因表达水平的半定量,进行横向的对比,希望能够找出这些基因在不同级别胶质瘤中的表达规律,为进一步的功能研究提供依据.方法:按照7条基因的Gen-Bank登录号,检索GenBank得到这些基因的全长cDNA序列,然后设计相应的PCR引物,针对22例恶性胶质瘤病人的肿瘤组织作检测,22例胶质瘤按照WHO分级其中I级3例,Ⅱ级8例,Ⅲ级7例,Ⅳ级4例,最后利用SmartView电泳图像分析软件对各个基因在不同组织中的表达进行半定量.结果:这些基因在这些肿瘤中的表达差异是有规律性的,和以前的基因芯片结果基本一致.如X54304(肌球蛋白轻链)、AI264216(胆碱转运因子2)都是随着恶性程度的进展而表达升高,而NM-019896(DNA多聚酶p12亚基)、NM-015962(CGI-35蛋白)、AB037886(NESH蛋白)、D38305(Tob蛋白)、M87507(半胱天冬酶1,Caspasel)都是随着恶性程度的进展而表达降低.结论:我们对于基因芯片和生物信息学技术筛选到的7条基因作半定量RT-PCR分析,证实我们使用的基因芯片是可靠的;同时显示这些基因在胶质瘤的恶性进展过程中都发生了规律性的改变,信息学检索提示其中有些基因可能是肿瘤恶变的重要调控因子.
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文献信息
篇名
半定量RT-PCR检测胶质瘤细胞分化相关新基因的表达
来源期刊
中国神经肿瘤杂志
学科
医学
关键词
胶质瘤
基因表达谱
生物信息学
RT-PCR
年,卷(期)
2003,(1)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
12-16
页数
5页
分类号
R739.41
字数
语种
中文
DOI
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
王爱东
苏州大学附属第二医院神经外科暨脑肿瘤研究室
70
388
12.0
15.0
2
董军
苏州大学附属第二医院神经外科暨脑肿瘤研究室
96
592
13.0
17.0
3
黄强
苏州大学附属第二医院神经外科暨脑肿瘤研究室
207
1479
19.0
27.0
4
兰青
苏州大学附属第二医院神经外科暨脑肿瘤研究室
228
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孙继勇
苏州大学附属第二医院神经外科暨脑肿瘤研究室
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研究主题发展历程
节点文献
胶质瘤
基因表达谱
生物信息学
RT-PCR
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国神经肿瘤杂志
主办单位:
中山大学肿瘤防治中心
中国抗癌协会神经肿瘤专业委员会
出版周期:
季刊
ISSN:
1726-8192
CN:
NR 4288-15-03
开本:
大16开
出版地:
广州市东风东路651号
邮发代号:
创刊时间:
2003
语种:
chi
出版文献量(篇)
773
总下载数(次)
2
总被引数(次)
2374
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