7型腺病毒疫苗株序列测定及其六邻体特性分析

• 作者: 姜秀丽 洪涛 温乐英 王健伟 石长信
• 来源期刊: 中华实验和临床病毒学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 腺病毒科 序列分析
• 年，卷（期）: 2003,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 305-309
• 页数: 5页
• 分类号: R65
• 字数: 3516字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1003-9279.2003.04.001

摘要

目的完成7型腺病毒疫苗株(Ad7v)的全序列测定并阐明其六邻体特征.方法克隆Ad7v基因组17.5～68.0 mu片段,应用Sanger双脱氧法进行DNA序列测定,将编码六邻体蛋白的核苷酸序列输入GenBank数据库中,获得录入号为AF515814.用CLUSTAL.V软件比较Ad7v与其他亚组及同一亚组腺病毒的六邻体蛋白的同源性,分析其抗原性的差异,同时用RasMo12.71软件预测Ad7v六邻体三维结构. 结果 Ad7v 17.5～68.0 mu由17 596个碱基组成.这段基因r链主要编码晚期基因L1、L2和L3,L链编码E2的一部分.六邻体编码多肽位于L3区,由934个氨基酸残基组成,与其他9个已知的六邻体蛋白序列进行多序列同源性比较,发现Ad7疫苗株与其他亚组腺病毒的同源性为86.8%(Ad4)～78.5%(Ad5).在同一亚组中,Ad7疫苗株与Ad3同源性最高,高达95.1%.可变序列主要集中在7个高变区( HVRs),根据Ad2六邻体三维结构模型预测Ad7六邻体三维结构,发现可变区大部分位于六邻体顶端的Ⅰ1和Ⅰ2环中.结论完成了Ad7v的全序列分析,其六邻体序列与Ad5、Ad2等其他亚组病毒有很大差异,这一结果为构建新型腺病毒载体打下了基础.