建立依赖型特异性核苷酸的乙型肝炎病毒基因分型方法

• 作者: 丛旭 王宇 王齐欣 蒋栋 许军 费然 陈红松 魏来
• 来源期刊: 中华检验医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 肝炎病毒,乙型 基因型 核苷酸类
• 年，卷（期）: 2003,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 76-78
• 页数: 3页
• 分类号: R511
• 字数: 2325字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/j:issn:1009-9158.2003.02.003

摘要

目的建立乙型肝炎病毒(HBV)基因型的新分型方法. 方法对HBV全基因序列和S基因片段序列,分别建立系统进化树作基因分型;同时,利用S基因片段序列中基因型特异性核苷酸,建立一种较为简单的基因分型方法.结果 S基因区进化树与全基因进化树在基因族的分布上基本相似.在S基因区,基因型A在核苷酸(nt)451位有型特异核苷酸T;基因型B在nt321位有A,nt324位有T,nt345位有G,nt408位有G;基因型C在nt293位有A,nt294位有C,nt491位有A;基因型D在nt290位有A;基因型E在nt619位有A;基因型F在nt287位有C,nt288位有T,nt294位有G,nt337位有T;基因型G在nt290位有G,nt306位有T,nt347位有T,nt481位有G.对18例基因型B和基因型C分子进化树进行分析,所得的基因型结果与S基因型特异核苷酸方法相同. 结论我们建立的一种依赖基因型特异性核苷酸的HBV基因分型方法,经分子进化树分析证明方法可靠.