在PCR-DGGE研究土壤微生物多样性中应用GC发卡结构的效应

• 作者: 张洪勋 王川 王晓谊 罗海峰 薛凯 齐鸿雁
• 来源期刊: 生态学报
• 关键词: PCR-DGGE 微生物多样性 GC发卡结构
• 年，卷（期）: 2003,（10）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 2170-2175
• 页数: 6页
• 分类号: Q938|S154.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-0933.2003.10.026

摘要

应用普通细胞裂解法提取3株实验菌株(Escherichia coli DH 5α, Staphylococcusaureus SA-1和Agrobacterium tumerfaciens 13129)的基因组DNA和应用基于高盐和长时高热的细胞裂解法提取7种不同土壤样品中的微生物的基因组DNA,两组不同结构的引物F357GC,R518(在正向引物的5′端有GC发卡结构)和F357,R518,分别对实验菌株和土壤样品中微生物的16S rRNA基因V3区进行扩增,均得到了目的片段.比较了不同引物扩增的16S r DNA片段在DGGE中的不同电泳行为,结果表明,含GC发卡结构的PCR扩增产物在DGGE中能够得到很好的分离,而无GC发卡结构的PCR产物则不能在DGGE中获得满意分离.引入GC发卡结构,使得对不同微生物的定性和分类更深入细致.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	齐鸿雁	中国科学院生态环境研究中心环境生物技术研究室	21	1238	13.0	21.0
2	张洪勋	中国科学院生态环境研究中心环境生物技术研究室	80	1980	23.0	43.0
3	王川	中国科学院生态环境研究中心环境生物技术研究室	18	301	6.0	17.0
4	王晓谊	中国科学院生态环境研究中心环境生物技术研究室	4	491	3.0	4.0
5	薛凯	中国科学院生态环境研究中心环境生物技术研究室	4	543	3.0	4.0
6	罗海峰	中国科学院生态环境研究中心环境生物技术研究室	9	520	5.0	9.0