茶尺蠖小RNA病毒5′端非编码区的克隆和测序及与哺乳动物小RNA病毒的比较分析

• 作者: 俞海洋 张珈敏 王小纯 胡远扬 蒋洪 谭莉
• 来源期刊: 昆虫学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 茶尺蠖小RNA病毒 哺乳动物小RNA病毒 5′端非编码区 结构分析
• 年，卷（期）: 2004,（5）
• 所属期刊栏目: 生理与生化
• 页码范围: 573-578
• 页数: 6页
• 分类号: Q966
• 字数: 4124字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:0454-6296.2004.05.005

摘要

用Trizol从纯化的茶尺蠖Ectropis oblique 小RNA病毒(EoPV)中提取病毒基因组RNA,逆转录后加poly(dT),然后进行两步PCR扩增基因组5′端.克隆测序后,对其5′端非编码区的核苷酸序列进行分析,发现具有哺乳动物小RNA病毒的5′端非编码区的一些特征:A/T含量丰富、起始密码子上游AUG和小顺反子多.利用mfold预测了EoPV 5′端非编码区的二级结构,存在4个茎环结构,有哺乳动物内部核糖体进入位点(IRES)的保守区域,即含保守基序GNRA的茎环A和A/C丰富的环B及多聚嘧啶区域.据此推测EoPV基因组翻译采用IRES起始机制.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张珈敏	武汉大学生命科学学院	34	221	10.0	13.0
2	胡远扬	武汉大学生命科学学院	35	228	9.0	14.0
3	王小纯	武汉大学生命科学学院	37	956	16.0	30.0
5	蒋洪	武汉大学生命科学学院	38	89	5.0	8.0
6	谭莉	武汉大学生命科学学院	5	4	1.0	2.0
9	俞海洋	武汉大学生命科学学院	1	3	1.0	1.0