基因表达谱芯片杂交影响因素的初步研究

• 作者: 李凌 毛向明 祝骥 郑文岭 马文丽
• 来源期刊: 生命科学研究
• 学科: 生物学
• 关键词: K562细胞 基因芯片 基因表达谱 杂交 限制性显示
• 年，卷（期）: 2004,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 133-139
• 页数: 7页
• 分类号: Q785
• 字数: 5596字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-7847.2004.02.008

摘要

通过对K562细胞基因表达谱芯片杂交影响因素的研究表明,用限制性显示技术[1]制备的cDNA探针长度较均一,适合基因芯片杂交;在42℃条件下含甲酰胺的杂交液中杂交16～20h,可保证样品的有效杂交,并表现出很好的杂交特异性;用RD-PCR或线性PCR对少量样品进行扩增,并用荧光(Cy3或Cy5)标记的通用引物对样品进行标记,可提高芯片检测的灵敏度;一次杂交反应总RNA的用量仅需0.5～10μg,在每cm2约含1000～1500个点的阵列中杂交时,标记样品用量1～2μg为宜;用PCR产物纯化柱对荧光标记产物进行纯化,可大大减小背景荧光,提高信噪比;同一批芯片经同一样品杂交结果的重复性很好,相关系数高达97.8%.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马文丽	第一军医大学分子生物学研究所	136	1135	16.0	27.0
2	郑文岭	广州军区广州总医院分子肿瘤研究所	200	1451	18.0	26.0
3	毛向明	第一军医大学分子生物学研究所	23	200	9.0	13.0
4	李凌	第一军医大学分子生物学研究所	21	328	9.0	18.0
5	祝骥	第一军医大学分子生物学研究所	7	133	7.0	7.0