STIL对胃癌细胞基因表达谱的影响

• 作者: 姜洪伟 王举 王永强 窦忠霞 袁宏伟
• 来源期刊: 中国医学科学院学报
• 关键词: 胃癌 STIL 基因表达谱芯片 生物信息学
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 778-786
• 页数: 9页
• 分类号: R735.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.3881/j.issn.1000-503X.11150

摘要

目的 采用基因表达谱芯片联合生物信息学分析,初步探索STIL促进胃癌发生发展的分子机制.方法 采用靶向STIL的慢病毒ShRNA(ShSTIL)以及乱码序列ShRNA(ShCon)转染SGC-7901胃癌细胞系,提取总RNA,合成cDNA,反转录合成生物素标记的核酸探针,片段化后与全基因组表达谱芯片杂交,采集数据,利用生物信息学对差异表达基因(DEGs)进行基因本体(GO)、 京都基因和基因组百科全书(KEGG)、 转录因子调控和蛋白互作分析.结果 与ShCon组相比,ShSTIL组显著上、 下调的基因分别为417个、87个(P<0.05,差异倍数>1或<-1).GO和KEGG分析显示,DEGs位于胞浆、 外泌体、 高尔基复合体及生物膜,与泛素介导的蛋白水解、 干细胞多能性调控及P53信号通路有关.KEGG通路相关基因、 转录因子调控及蛋白互作联合分析显示,IGF1R、STUB1、SKP2、FOXO1位于网络的中心位置,可能与胃癌发生发展密切相关.结论 STIL可能通过互作激活E3泛素连接酶STUB1或SKP2,促进转录因子FOXO1降解,调控IGF1R表达,从而促进胃癌的发生发展.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王举	内蒙古自治区人民医院胃肠外科	32	81	5.0	6.0
2	王永强	内蒙古自治区人民医院胃肠外科	17	32	4.0	4.0
3	姜洪伟	内蒙古自治区人民医院胃肠外科	43	161	6.0	9.0
4	窦忠霞	内蒙古自治区人民医院胃肠外科	8	14	3.0	3.0