日本血吸虫(大陆株)成虫表达序列标签的获取及电子延伸

• 作者: 余新炳 刘翰腾 吴忠道 徐劲 李华文 李宝华 李焱 邵筱
• 来源期刊: 中国地方病学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 日本血吸虫 表达序列标签 生物信息学 电子延伸
• 年，卷（期）: 2004,（4）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 297-299
• 页数: 3页
• 分类号: R5
• 字数: 2982字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1000-4955.2004.04.004

摘要

目的获取日本血吸虫(Schistosoma japonicum,Sj)新基因.方法从Sj(大陆株)成虫cDNA文库中随机挑选单个重组克隆进行部分测序以获取表达序列标签(expressed sequence tag,EST),用其提供的BLAST程序和Genebank数据库进行序列比较和同源性分析;建立电子拼接的方法,对所获EST进行电子延伸,并对Si延伸后序列进行同源性分析.结果在Si成虫cDNA文库中,随机挑选182个单个重组克隆,获取53个有价值EST序列,并在Genebank中登录,获得53个EST的延伸序列及分析结果.结论 Si表达基因EST测序、同源性分析及EST的电子延伸是获取Sj新基因的有效对策.