ortholog--概念、生物信息预测方法和数据库

• 作者: 朱晟 薛成海 陈作舟 陈良标
• 来源期刊: 生物物理学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 水平同源 垂直同源 基因重复 物种形成 系统发生 生物信息学
• 年，卷（期）: 2004,（2）
• 所属期刊栏目: 生物信息学
• 页码范围: 137-142
• 页数: 6页
• 分类号: Q75
• 字数: 4018字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-6737.2004.02.009

摘要

orthologs指起源于不同物种的最近的共同祖先的一些基因.orthologous的基因,具有相近甚至相同的功能,由相似的途径调控,在不同的物种中扮演相似甚至相同的角色,因此在基因组序列的注释中,是最可靠的选择.orthologs的生物信息预测方法主要有两类:系统发生方法和序列比对方法.这两类方法都是基于序列的相似性,但又各有特点.系统发生方法通过重建系统发生树来预测orthologs,因此在概念上比较精确,但难于自动化,运算量也很大.序列比对方法在概念上比较粗糙,但简单实用,运算量相对较小,因此得到了较广泛的应用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈作舟	浙江大学生命科学院	5	53	5.0	5.0
5	朱晟	中国科学院遗传与发育生物学研究所	2	7	1.0	2.0
6	薛成海	中国科学院自动化研究所复杂系统与智能科学国家重点实验室	1	6	1.0	1.0
7	陈良标	中国科学院遗传与发育生物学研究所	7	59	5.0	7.0