球形棕囊藻(Phaeocystis globosa)叶绿体psaA基因片段的序列分析

• 作者: Hodgkiss 吕颂辉 杨泽民 章群 谢数涛 韩博平
• 来源期刊: 热带亚热带植物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 球形棕囊藻 南极棕囊藻 psaA基因 DNA序列 氨基酸序列 RNA二级结构 藻类
• 年，卷（期）: 2004,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 435-439
• 页数: 5页
• 分类号: Q949.261
• 字数: 3456字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-3395.2004.05.008

摘要

根据GenBank中检索到的南极棕囊藻(phaeocystis antarctica)psaA基因序列设计psaAL和psaAR引物,对球形棕囊藻(Phaeocystis globosa)的psaA基因片段进行PCR扩增并测序,获得了629bp的DNA序列.应用Clustal X对球形棕囊藻P1、P2株系和南极棕囊藻的psaA基因片段序列进行比对,结果表明,球形棕囊藻psaA基因片段序列无插入/缺失,核苷酸差异率为3.34%.应用DNAstar分析软件推断球形棕囊藻和南极棕囊藻的psaA基因对应的氨基酸序列和RNA二级结构,发现它们的氨基酸序列差异不大,序列中209个氨基酸只有1个发生了变化,其氨基酸变异率为048%;除部分结构域比较相似外,RNA二级结构上体现一定程度的差异,这可能对棕囊藻的分子分类研究有参考价值.因所获得的psaA基因片段序列及氨基酸序列具有种的极端保守性,不适宜用作Phaeocystis属种间的分子分类研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	章群	暨南大学水生生物研究所	86	843	17.0	23.0
2	韩博平	暨南大学水生生物研究所	192	4189	32.0	56.0
3	吕颂辉	暨南大学水生生物研究所	107	1534	23.0	34.0
4	谢数涛	暨南大学水生生物研究所	33	328	10.0	16.0
5	杨泽民	暨南大学水生生物研究所	7	63	5.0	7.0
6	Hodgkiss	香港大学生物多样性系	2	20	2.0	2.0