问号钩端螺旋体全基因组的更新注释

• 作者: 宋卫峰 赵蔚 郭晓奎
• 来源期刊: 上海第二医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 问号钩端螺旋体 注释 基因组
• 年，卷（期）: 2004,（6）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 421-425
• 页数: 5页
• 分类号: R377.5|R446
• 字数: 2809字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-8115.2004.06.003

摘要

目的对问号钩端螺旋体黄疸出血群赖型赖株全基因组数据库中未注释的基因进行重新注释,并寻找可能的新致病基因.方法将钩端螺旋体黄疸出血群赖型赖株全基因组数据库中功能未知的编码序列(CDSs)在BLASTP/NCBI数据库中比较,初步预测基因功能,对可能的致病基因及其编码产物运用多种生物学软件进行深入分析.结果未知CDSs中有82个与NCBI数据库中的编码蛋白序列有很高的同源性,其中LA0063和LA3291编码金属蛋白酶,可能与致病有关.结论通过钩端螺旋体黄疸出血群赖株全基因组数据库中功能未知的CDSs进行定期比对,可以不断完善该数据库的功能注释,同时可以发现新的致病基因,有助于钩端螺旋体病致病机理的最终阐明.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭晓奎	上海第二医科大学基础医学院病原生物学教研室	43	241	8.0	13.0
2	赵蔚	上海第二医科大学基础医学院病原生物学教研室	7	27	4.0	5.0
3	宋卫峰	上海第二医科大学基础医学院病原生物学教研室	1	4	1.0	1.0