胶质母细胞瘤基因表达谱及相关基因的聚类研究

• 作者: 卢亦成 应康 李瑶 楼美清 胡国汉 谢毅 陈菊祥 骆纯
• 来源期刊: 中华神经外科疾病研究杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 脑胶质母细胞瘤 基因芯片 表达谱 Hierarchical聚类
• 年，卷（期）: 2004,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 222-225
• 页数: 4页
• 分类号: R739.4
• 字数: 3214字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-2897.2004.03.009

摘要

目的探讨人脑胶质母细胞瘤发生、发展中相关基因的表达及功能.方法用含13 939种人类基因的BioStarH140S型表达谱芯片,以正常成人脑及不同级别胶质瘤组织总RNA制备的探针杂交芯片;ScanArray 4000扫描芯片荧光信号,提取脑及胶质瘤组织差异基因并进行生物信息分析;用Hierarchical聚类对胶质瘤差异基因进行特征提取;用Northern杂交验证及进行初步功能研究.结果正常脑与18例不同级别胶质瘤组织间筛选出多类差异表达基因,通过生物信息学和Hierarchical聚类,发现α-连环素、微型染色体维护蛋白7、细胞周期素B2、FBX05、着丝粒蛋白F基因与胶质母细胞瘤密切相关,该类基因在低级别胶质瘤中表达差异不明显,但胶质母细胞瘤中表达明显上调.Northern杂交显示该类基因与胶质母细胞瘤密切相关,与芯片结果一致.结论基因表达谱芯片可快速、高效地筛选胶质瘤相关基因,发现的5条基因与胶质母细胞瘤侵袭性强密切相关,可成为判断胶质瘤预后的分子生物学指标.