日本血吸虫7个基因全长cDNA的获取和分析

• 作者: 万志刚 刘传爱 廖力 张愉快 曾桥 杨秋林 肖建华
• 来源期刊: 中国人兽共患病杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 日本血吸虫 cDNA文库 基因 生物信息学
• 年，卷（期）: 2004,（12）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1058-1061
• 页数: 4页
• 分类号: R383.2
• 字数: 2364字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2004.12.010

摘要

目的从日本血吸虫成虫cDNA文库中分离、鉴定和分析全长cDNA序列,为日本血吸虫病的防治提供候选疫苗和药物靶点.方法从构建日本血吸虫成虫cDNA文库中挑取重组阳性克隆进行5'测序获取表达序列标签(Expressed Sequence Tag,EST),在此基础上进行引物延伸法(primer extension)测序,直至获取全长cDNA序列,将获取的基因登录GenBank,并进行生物信息学分析.结果获得7个日本血吸虫全长cDNA序列(GenBank登录号分别为AY336493～AY336499),其中6个为日本血吸虫新基因:类转录因子BTF3(similar to transcription factor BTF3)、延长因子1-α(elongation factor 1-alpha,EF1-α)、富含谷氨酰胺四联重复肽(small glutamine-rich tetratricopeptide,TRP)、鸟氨酸氨基转移酶(ornithine aminotransferase,OA)、内皮差异相关因子1(endothelial differentiation-related factor 1,EDF-1)和类基因转录增强因子(similar to testis enhanced gene transcript protein,TEGT);另1个是精氨酸酶(arginase)基因,比原发现的基因序列长456bp.生物信息学分析发现类基因转录增强因子为跨膜蛋白,具有6个跨膜区;各基因与人、鼠、蟾和曼氏血吸虫等物种的基因有37%～85%的同源性;蛋白结构和功能预测分析显示各基因分别含有NAC基元、精氨酸酶家族特征性序列、TEF基元、TRP基元、转氨酶基元、HTH-XRE基元和NAF位点,预示各基因分别具有相应的功能.结论 EST技术和引物延伸法有助于快速、经济地获取和研究日本血吸虫表达基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨秋林	南华大学病原生物学研究所	42	292	9.0	16.0
2	廖力	南华大学病原生物学研究所	91	378	9.0	13.0
3	肖建华	南华大学病原生物学研究所	75	276	9.0	12.0
4	张愉快	南华大学病原生物学研究所	45	337	11.0	17.0
5	刘传爱	南华大学病原生物学研究所	28	61	5.0	6.0
6	曾桥	南华大学病原生物学研究所	22	74	5.0	7.0
7	万志刚	南华大学病原生物学研究所	12	31	2.0	5.0